RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488576.5

FAM107B-222, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		3.61	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		3.61	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	CCDC140	Q96MF4	163 aa		3.61	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		3.61	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	JAM3	Q9BX67	310 aa		3.61	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		3.61	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	CEP72	Q9P209	647 aa		3.61	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	ESYT3	A0FGR9	886 aa		3.6	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	GFRA1	P56159	465 aa		3.6	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	CCDC142	Q17RM4	750 aa		3.6	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		3.6	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		3.6	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	FOXN1	O15353	648 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	ARHGAP6	O43182	974 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	RECK	O95980	971 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	NFYC	Q13952	458 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	TBR1	Q16650	682 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	SV2C	Q496J9	727 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	GPRASP2	Q96D09	838 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	C1orf159	Q96HA4	380 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	SCYL1	Q96KG9	808 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		3.59	□□□□□ -1.83
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	HHEX	Q03014	270 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	FSTL1	Q12841	308 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	CFHR4	Q92496	578 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	MSL2	Q9HCI7	577 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	CAPN14	A8MX76	684 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	MSC	O60682	206 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	PEX11B	O96011	259 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	COL6A2	P12110	1019 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	PDE6A	P16499	860 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	ADRA1B	P35368	520 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	ETV4	P43268	484 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	GRM7	Q14831	915 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	UNCX	A6NJT0	531 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	ACOT7	O00154	380 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	GNAT1	P11488	350 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	VAMP1	P23763	118 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	GJA4	P35212	333 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	KCNQ1	P51787	676 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	USP30	Q70CQ3	517 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	D2HGDH	Q8N465	521 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	NELFA	Q9H3P2	528 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	GPR27	Q9NS67	375 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	CYP27B1	O15528	508 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	NUDT3	O95989	172 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	HMGCR	P04035	888 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	GRK2	P25098	689 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	GRK3	P35626	688 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	EPHA5	P54756	1037 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	CRHR2	Q13324	411 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	KCTD1	Q719H9	257 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM107B-222	ENST00000488576	GPR135	Q8IZ08	494 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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