RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483164.5

GIGYF2-238, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 5

Gene GIGYF2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-238	ENST00000483164	CP	P00450	1065 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	FAM153B	P0C7A2	387 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	BDNF	P23560	247 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	ECI1	P42126	302 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	KCNAB2	Q13303	367 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	DIO2	Q92813	273 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	TEPSIN	Q96N21	525 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	ADCY3	O60266	1144 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	EYA4	O95677	639 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	MAN1A1	P33908	653 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	BCL6	P41182	706 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	KCNC1	P48547	511 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	MROH9	Q5TGP6	573 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	PASD1	Q8IV76	773 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	SEC14L1	Q92503	715 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	SYT3	Q9BQG1	590 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	CDIP1	Q9H305	208 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164		A0A1W2PQU0	124 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	EXOC5	O00471	708 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	RFPL1	O75677	317 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	COL6A1	P12109	1028 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	LCP1	P13796	627 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	PTMS	P20962	102 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	PPP2R2A	P63151	447 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	KSR2	Q6VAB6	950 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	DGKH	Q86XP1	1220 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	CARF	Q8N187	725 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	GPATCH11	Q8N954	259 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	DDX11	Q96FC9	970 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	SPATA25	Q9BR10	227 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	BTG4	Q9NY30	223 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		7	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	KATNA1	O75449	491 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	NPTXR	O95502	500 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	SYN1	P17600	705 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	LTBR	P36941	435 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	GTF2A2	P52657	109 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	MLC1	Q15049	377 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	WDR78	Q5VTH9	848 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	CEP68	Q76N32	757 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	AHI1	Q8N157	1196 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	UBR7	Q8N806	425 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	PALD1	Q9ULE6	856 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	NOBOX	O60393	691 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	CYP2C8	P10632	490 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	KRTAP10-2	P60368	255 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	E2F7	Q96AV8	911 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF69	Q9UC07	566 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164		H7BY64	318 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	TBX3	O15119	743 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	MAP4K2	Q12851	820 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	MTMR1	Q13613	665 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	CR1L	Q2VPA4	569 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GIGYF2-238	ENST00000483164	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29

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