RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 IKQ13123 557 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 DDX12PQ92771 950 aa7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 P2RX5Q93086 422 aa7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 MTMR7Q9Y216 660 aa7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 WDR64B1ANS9 1081 aa7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 CCNE2O96020 404 aa7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 FANCCQ00597 558 aa7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 MCM6Q14566 821 aa7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 BORCS6Q96GS4 357 aa7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 TXNRD2Q9NNW7 524 aa7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 DMAC2Q9NW81 257 aa7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 DNM3Q9UQ16 869 aa7.19□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 A0A1W2PQJ5 194 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 POTEB3A0JP26 581 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 GAS7O60861 476 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 KIF20AO95235 890 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 PIGRP01833 764 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 PSMC5P62195 406 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 OLFML2BQ68BL8 750 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 POTEBQ6S5H4 581 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 TTYH3Q9C0H2 523 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 VTA1Q9NP79 307 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 COL1A2P08123 1366 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 BTBD19C9JJ37 291 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 PDXKO00764 312 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 GNA14O95837 355 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 HOXD13P35453 343 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 TRIM14Q14142 442 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 STXBP2Q15833 593 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 ARHGEF16Q5VV41 709 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 FAM43AQ8N2R8 423 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 LINC01465Q8N7H1 131 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 C2orf69Q8N8R5 385 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 EDEM3Q9BZQ6 932 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.18□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 SLC15A5A6NIM6 579 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 QARSP47897 775 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 CDK17Q00537 523 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 GNPTABQ3T906 1256 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 NELFBQ8WX92 580 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 ERGIC2Q96RQ1 377 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 EXOC1Q9NV70 894 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 FZD1Q9UP38 647 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 Q9Y3F1 56 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 ASB14A6NK59 587 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 POTEIP0CG38 1075 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 POTEJP0CG39 1038 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 ATP2B1P20020 1258 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 MAPK4P31152 587 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 SLC26A2P50443 739 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 STK4Q13043 487 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 STIM1Q13586 685 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 DAW1Q8N136 415 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC51Q96ER9 411 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 OTUD5Q96G74 571 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 DYDC2Q96IM9 177 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 PSMA7O14818 248 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 CCNA1P78396 465 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 GTF2BQ00403 316 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 POU5F1BQ06416 359 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKCI-202ENST00000476635 FSTL1Q12841 308 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms