RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 CAND2O75155 1236 aa12.87□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 DNAJB1P25685 340 aa12.87□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 KIF5BP33176 963 aa12.87□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 HYAL1Q12794 435 aa12.87□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 MTMR1Q13613 665 aa12.87□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 FBXO47Q5MNV8 452 aa12.87□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.87□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 CASC1Q6TDU7 716 aa12.87□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 SEPT1Q8WYJ6 367 aa12.87□□□□□ -0.35
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ACTB-209ENST00000473257 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa12.87□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa12.87□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa12.87□□□□□ -0.35
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ACTB-209ENST00000473257 INSRRP14616 1297 aa12.86□□□□□ -0.35
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ACTB-209ENST00000473257 MICU3Q86XE3 530 aa12.86□□□□□ -0.35
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ACTB-209ENST00000473257 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 TMEM260Q9NX78 707 aa12.86□□□□□ -0.35
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ACTB-209ENST00000473257 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 CAMK1Q14012 370 aa12.85□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 COL19A1Q14993 1142 aa12.85□□□□□ -0.35
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ACTB-209ENST00000473257 WWC2Q6AWC2 1192 aa12.85□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa12.85□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 PPP1R16BQ96T49 567 aa12.85□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 MAP3K14Q99558 947 aa12.85□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 JADE2Q9NQC1 790 aa12.85□□□□□ -0.35
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ACTB-209ENST00000473257 HCSTQ9UBK5 93 aa12.85□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 TRPC6Q9Y210 931 aa12.85□□□□□ -0.35
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ACTB-209ENST00000473257 TBX10O75333 385 aa12.84□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 DGKIO75912 1065 aa12.84□□□□□ -0.35
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ACTB-209ENST00000473257 FANCBQ8NB91 859 aa12.84□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 LZTS2Q9BRK4 669 aa12.84□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa12.84□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 TMX1Q9H3N1 280 aa12.84□□□□□ -0.35
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ACTB-209ENST00000473257 CDHR5Q9HBB8 845 aa12.84□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 KCNH7Q9NS40 1196 aa12.84□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 BRPF3Q9ULD4 1205 aa12.84□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 SLC12A7Q9Y666 1083 aa12.84□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa12.84□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa12.84□□□□□ -0.35
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ACTB-209ENST00000473257 PPFIA3O75145 1194 aa12.83□□□□□ -0.36
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ACTB-209ENST00000473257 SMARCA1P28370 1054 aa12.83□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 GNAQP50148 359 aa12.83□□□□□ -0.36
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ACTB-209ENST00000473257 RSPH3Q86UC2 560 aa12.83□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 MXRA8Q9BRK3 442 aa12.83□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 ANO2Q9NQ90 1003 aa12.83□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 SLC9A2Q9UBY0 812 aa12.83□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 PADI3Q9ULW8 664 aa12.83□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 PLAGL2Q9UPG8 496 aa12.83□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 GINS2Q9Y248 185 aa12.83□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa12.83□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 KIAA1671Q9BY89 1806 aa12.83□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 PRR33A8MZF0 331 aa12.82□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 DCXO43602 365 aa12.82□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 CCNE2O96020 404 aa12.82□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 NAPAP54920 295 aa12.82□□□□□ -0.36
ACTB-209ENST00000473257 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
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