RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466657.1

SIKE1-205, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIKE1, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-205ENST00000466657 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.47■□□□□ 0.87
SIKE1-205ENST00000466657 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SIKE1-205ENST00000466657 NID2Q14112 1375 aa20.46■□□□□ 0.87
SIKE1-205ENST00000466657 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.46■□□□□ 0.87
SIKE1-205ENST00000466657 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.46■□□□□ 0.87
SIKE1-205ENST00000466657 SREBF1P36956 1147 aa20.46■□□□□ 0.87
SIKE1-205ENST00000466657 AP3B2Q13367 1082 aa20.46■□□□□ 0.87
SIKE1-205ENST00000466657 CEP55Q53EZ4 464 aa20.46■□□□□ 0.87
SIKE1-205ENST00000466657 HLA-CQ95604 372 aa20.46■□□□□ 0.87
SIKE1-205ENST00000466657 SAMD11Q96NU1 681 aa20.46■□□□□ 0.87
SIKE1-205ENST00000466657 ANO3Q9BYT9 981 aa20.46■□□□□ 0.87
SIKE1-205ENST00000466657 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.46■□□□□ 0.87
SIKE1-205ENST00000466657 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.46■□□□□ 0.87
SIKE1-205ENST00000466657 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.46■□□□□ 0.87
SIKE1-205ENST00000466657 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.45■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.45■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 MEIS1O00470 390 aa20.45■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 ADCY7P51828 1080 aa20.45■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 FBXL16Q8N461 479 aa20.45■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 IL27Q8NEV9 243 aa20.45■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.45■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 GLG1Q92896 1179 aa20.45■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.45■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 SMCO2A6NFE2 343 aa20.44■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.44■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 ATG7O95352 703 aa20.44■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 ARP10275 920 aa20.44■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 MARK3P27448 753 aa20.44■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 LPIN1Q14693 890 aa20.44■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.44■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.44■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.44■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 PGBD1Q96JS3 809 aa20.44■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 MYO7AQ13402 2215 aa20.43■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 ESYT2A0FGR8 921 aa20.43■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 INSRRP14616 1297 aa20.43■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 HSPA4P34932 840 aa20.43■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 ACTR2P61160 394 aa20.43■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.43■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 RSPH3Q86UC2 560 aa20.43■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.43■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.43■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.42■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 GHRP10912 638 aa20.42■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 PLCB4Q15147 1175 aa20.42■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 EPC2Q52LR7 807 aa20.42■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 YME1L1Q96TA2 773 aa20.42■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 SDF4Q9BRK5 362 aa20.42■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 AZI2Q9H6S1 392 aa20.42■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 TMEM260Q9NX78 707 aa20.42■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 SQORQ9Y6N5 450 aa20.42■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 H3BNC9 293 aa20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 LINC00271P0C7V0 271 aa20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 SLC26A2P50443 739 aa20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.41■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 DHX15O43143 795 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 UPP2O95045 317 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 CYP3A4P08684 503 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 SCG2P13521 617 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 CPA1P15085 419 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 STAT5BP51692 787 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 APOBRQ0VD83 1088 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 PKN1Q16512 942 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 Q6ZUG5 572 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 TMEM192Q8IY95 271 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.4■□□□□ 0.86
SIKE1-205ENST00000466657 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-205ENST00000466657 FAM86B1E9PN63 330 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-205ENST00000466657 ENPP3O14638 875 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-205ENST00000466657 CCNE2O96020 404 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-205ENST00000466657 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-205ENST00000466657 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-205ENST00000466657 BRF1Q92994 677 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-205ENST00000466657 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-205ENST00000466657 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SIKE1-205ENST00000466657 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-205ENST00000466657 ADAMTS3O15072 1205 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-205ENST00000466657 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-205ENST00000466657 EVCP57679 992 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-205ENST00000466657 IGBP1P78318 339 aa20.38■□□□□ 0.85
SIKE1-205ENST00000466657 NTRK3Q16288 839 aa20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms