RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 SETD4Q9NVD3 440 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CHD9Q3L8U1 2897 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 STK36Q9NRP7 1315 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 MSH4O15457 936 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 MAFGO15525 162 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 LGR5O75473 907 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC34A2O95436 690 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 TDP2O95551 362 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CKBP12277 381 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 GNA11P29992 359 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF76P36508 570 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 ACTR2P61160 394 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 NR5A1Q13285 461 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 MBTPS1Q14703 1052 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD1Q15327 319 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 MARCH8Q5T0T0 291 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 ABHD15Q6UXT9 468 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 NIPA1Q7RTP0 329 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFB128Q7Z7B8 93 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFRSF25Q93038 417 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 GLT8D2Q9H1C3 349 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 IL23AQ9NPF7 189 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC9A2Q9UBY0 812 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 NFASCO94856 1347 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 POTEMA6NI47 508 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC37A4O43826 429 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 NBNO60934 754 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 PBX2P40425 430 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 GUCY1B3Q02153 619 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 INF2Q27J81 1249 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR16Q569H4 304 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF618Q5T7W0 954 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM199Q8N511 208 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 C7orf31Q8N865 590 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CDHR1Q96JP9 859 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 MBOAT7Q96N66 472 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 KATNAL1Q9BW62 490 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 C17orf102A2RUQ5 167 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 BTBD18B2RXH4 712 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP3A7P24462 503 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 USP11P51784 963 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 RBL2Q08999 1139 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 PTK7Q13308 1070 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 PLCB4Q15147 1175 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT40Q6A162 431 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 SERINC5Q86VE9 423 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 ETNPPLQ8TBG4 499 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 BICD2Q8TD16 824 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 HERVK_113Q902F9 699 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF577Q9BSK1 485 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 BACH2Q9BYV9 841 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 EMSYQ7Z589 1322 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 ARID2Q68CP9 1835 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB42B2RXF5 422 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 EML1O00423 815 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF862O60290 1169 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMD10O75832 226 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 CDKL5O76039 1030 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGEF15O94989 841 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 STBD1O95210 358 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 FGBP02675 491 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 INSRRP14616 1297 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 MYOGP15173 224 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 RABGGTBP53611 331 aa7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms