RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460978.1

ULK4-208, Transcript of unc-51 like kinase 4, human

TSL 2

Gene ULK4, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ULK4-208	ENST00000460978	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978		X6R8D5	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	GRIA2	P42262	883 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	GYS2	P54840	703 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	C22orf46	C9J442	243 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978		H7BY64	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	DLX3	O60479	287 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	B4GALT4	O60513	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	AMPD3	Q01432	767 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	LSAMP	Q13449	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	EDA	Q92838	391 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	ADCY3	O60266	1144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	ZNF202	O95125	648 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	COL6A1	P12109	1028 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	CEP68	Q76N32	757 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	PRODH	O43272	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	BCL6	P41182	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	CHRNA2	Q15822	529 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	SPATC1	Q76KD6	591 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ULK4-208	ENST00000460978	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	FOXS1	O43638	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	MCM7	P33993	719 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	MASP1	P48740	699 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ULK4-208	ENST00000460978	WASF3	Q9UPY6	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms