RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 AMPD3Q01432 767 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 STK4Q13043 487 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT76Q01546 638 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 CDHR1Q96JP9 859 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 CREBZFQ9NS37 354 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR64B1ANS9 1081 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 RSPH10BP0C881 870 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 CAP1Q01518 475 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 MAML3Q96JK9 1138 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 RASSF10A6NK89 507 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 SFI1A8K8P3 1242 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 GGPS1O95749 300 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 TBC1D8O95759 1140 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 PRCPP42785 496 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 NCAPHQ15003 741 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 BECN2A8MW95 431 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 CA12O43570 354 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 EYA4O95677 639 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 NOGQ13253 232 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 NFASCO94856 1347 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF862O60290 1169 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 CCL14Q16627 93 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 MORC4Q8TE76 937 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 RHOBTB3O94955 611 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC41Q15345 812 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 MORN1Q5T089 497 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 MLKLQ8NB16 471 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 REEP2Q9BRK0 252 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 HSD3B7Q9H2F3 369 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 EXOC1Q9NV70 894 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 ASB14A6NK59 587 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 ESPNB1AK53 854 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT18P05783 430 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 MYL1P05976 194 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP2B6P20813 491 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 JAK3P52333 1124 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 NPEPPSP55786 919 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 GIT2Q14161 759 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 TAPT1Q6NXT6 567 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 KIAA0895Q8NCT3 520 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 NACC1Q96RE7 527 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 STK24Q9Y6E0 443 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 B4DLN1 442 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 KCNB1Q14721 858 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 PANK4Q9NVE7 773 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 SFNP31947 248 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 ADCYAP1R1P41586 468 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 UNC13DQ70J99 1090 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 KATNBL1Q9H079 304 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-204ENST00000452765 BACH1O14867 736 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC26A4O43511 780 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 COASYQ13057 564 aa23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms