RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 PRRX2Q99811 253 aa13.38□□□□□ -0.27
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PRAME-210ENST00000442481 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
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PRAME-210ENST00000442481 SP4Q02446 784 aa13.33□□□□□ -0.28
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PRAME-210ENST00000442481 TRIM50Q86XT4 487 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 SEPT1Q8WYJ6 367 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 GLG1Q92896 1179 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 BCAS3Q9H6U6 928 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
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