RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 GRM4Q14833 912 aa16.89■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.89■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 AK8Q96MA6 479 aa16.89■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 TSG101Q99816 390 aa16.89■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa16.89■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 TLDC2A0PJX2 215 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 SLC18A3Q16572 532 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 ECM1Q16610 540 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 ANKS1AQ92625 1134 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM47Q9BQJ4 181 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 RNF14Q9UBS8 474 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 KRIT1O00522 736 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 TTI1O43156 1089 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 SERPINB2P05120 415 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 PPP2R2AP63151 447 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 CEP72Q9P209 647 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa16.88■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 LAD1O00515 517 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 GYS1P13807 737 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 EPS15P42566 896 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 IFFO1Q0D2I5 559 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 ASIC2Q16515 512 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 CALCRLQ16602 461 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 SOGA3Q5TF21 947 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 PIGSQ96S52 555 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 PAGR1Q9BTK6 254 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 VEZTQ9HBM0 779 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 GGT7Q9UJ14 662 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 PTK2Q05397 1052 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 COA7Q96BR5 231 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 HVCN1Q96D96 273 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 TRIM51Q9BSJ1 452 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 GOPCQ9HD26 462 aa16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 C6orf229H3BNL8 230 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 RIMBP2O15034 1052 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 KIF4AO95239 1232 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 PCP11498 1178 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 MYOCDQ8IZQ8 938 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 F8W031 263 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 PAX7P23759 505 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 PPP1R7Q15435 360 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 ACCSLQ4AC99 568 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 KRT25Q7Z3Z0 450 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 METTL13Q8N6R0 699 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 IQCDQ96DY2 449 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 PNMA2Q9UL42 364 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 SLC9A1P19634 815 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 EMC10Q5UCC4 262 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 WDR66Q8TBY9 1149 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 LRRC45Q96CN5 670 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 C6orf50Q9HD87 102 aa16.86■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 PPP1R2P41236 205 aa16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 MMP14P50281 582 aa16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 LRRC63Q05C16 580 aa16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 DGKHQ86XP1 1220 aa16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 TCP11Q8WWU5 503 aa16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 SGSM3Q96HU1 749 aa16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 SLC24A3Q9HC58 644 aa16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 NR2E1Q9Y466 385 aa16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 MARCH6O60337 910 aa16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 COASYQ13057 564 aa16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 RAD54LQ92698 747 aa16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 IRS2Q9Y4H2 1338 aa16.85■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 MYBP10242 640 aa16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 GNAQP50148 359 aa16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms