RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
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PLEKHF1-201ENST00000436066 AMPD2Q01433 879 aa27.87■■■□□ 2.05
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PLEKHF1-201ENST00000436066 HSD17B4P51659 736 aa27.84■■■□□ 2.05
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PLEKHF1-201ENST00000436066 CPXCR1Q8N123 301 aa27.82■■■□□ 2.04
PLEKHF1-201ENST00000436066 LPAR1Q92633 364 aa27.82■■■□□ 2.04
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM53CQ9NYF3 392 aa27.82■■■□□ 2.04
PLEKHF1-201ENST00000436066 COL20A1Q9P218 1284 aa27.82■■■□□ 2.04
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PLEKHF1-201ENST00000436066 CTAGE4Q8IX94 777 aa27.82■■■□□ 2.04
PLEKHF1-201ENST00000436066 MYCT1Q8N699 235 aa27.82■■■□□ 2.04
PLEKHF1-201ENST00000436066 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
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PLEKHF1-201ENST00000436066 KRT222Q8N1A0 295 aa27.81■■■□□ 2.04
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PLEKHF1-201ENST00000436066 NACC1Q96RE7 527 aa27.81■■■□□ 2.04
PLEKHF1-201ENST00000436066 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa27.81■■■□□ 2.04
PLEKHF1-201ENST00000436066 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
PLEKHF1-201ENST00000436066 FHOD1Q9Y613 1164 aa27.81■■■□□ 2.04
PLEKHF1-201ENST00000436066 ASTN1O14525 1302 aa27.81■■■□□ 2.04
PLEKHF1-201ENST00000436066 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
PLEKHF1-201ENST00000436066 ITGB5P18084 799 aa27.8■■■□□ 2.04
PLEKHF1-201ENST00000436066 MUTP22033 750 aa27.8■■■□□ 2.04
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