RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 FBXL16Q8N461 479 aa23.98■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 ANO3Q9BYT9 981 aa23.98■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.98■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.97■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 SMCO2A6NFE2 343 aa23.97■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 MARK3P27448 753 aa23.97■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.97■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.97■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-CQ95604 372 aa23.97■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 PCYT2Q99447 389 aa23.97■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 SDF4Q9BRK5 362 aa23.97■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.97■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.96■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.96■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.96■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.96■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 YME1L1Q96TA2 773 aa23.96■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.96■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 AZI2Q9H6S1 392 aa23.96■■□□□ 1.43
LIMS1-208ENST00000428064 ESYT2A0FGR8 921 aa23.95■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.95■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 MEIS1O00470 390 aa23.95■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 HSPA4P34932 840 aa23.95■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 KCNQ1P51787 676 aa23.95■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 PGBD1Q96JS3 809 aa23.95■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.95■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 ATG7O95352 703 aa23.94■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 ARP10275 920 aa23.94■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 SLC26A2P50443 739 aa23.94■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 ACTR2P61160 394 aa23.94■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 LPIN1Q14693 890 aa23.94■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 MCTP2Q6DN12 878 aa23.94■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.94■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 SQORQ9Y6N5 450 aa23.94■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 GHRP10912 638 aa23.93■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 SCG2P13521 617 aa23.93■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 INSRRP14616 1297 aa23.93■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 FGD1P98174 961 aa23.93■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 EPC2Q52LR7 807 aa23.93■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO47Q5MNV8 452 aa23.93■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.93■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.93■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 CRYGNQ8WXF5 182 aa23.93■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa23.92■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 CYP3A4P08684 503 aa23.92■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZUG5 572 aa23.92■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.92■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM260Q9NX78 707 aa23.92■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.92■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.92■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 BDP1A6H8Y1 2624 aa23.91■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 H3BNC9 293 aa23.91■■□□□ 1.42
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LIMS1-208ENST00000428064 STAT5BP51692 787 aa23.91■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 APOBRQ0VD83 1088 aa23.91■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 PLCB4Q15147 1175 aa23.91■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 PTPROQ16827 1216 aa23.91■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 IER5Q5VY09 327 aa23.91■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.91■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 TRPC6Q9Y210 931 aa23.91■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.91■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa23.9■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 IGBP1P78318 339 aa23.9■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 BRF1Q92994 677 aa23.9■■□□□ 1.42
LIMS1-208ENST00000428064 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 FAM86B1E9PN63 330 aa23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 CPA1P15085 419 aa23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 RPS6KB1P23443 525 aa23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF76P36508 570 aa23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM192Q8IY95 271 aa23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 IL17RAQ96F46 866 aa23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf50Q9HD87 102 aa23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.89■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 NCOR1O75376 2440 aa23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 POTEB3A0JP26 581 aa23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf67F2Z3F1 127 aa23.88■■□□□ 1.41
LIMS1-208ENST00000428064 ENPP3O14638 875 aa23.88■■□□□ 1.41
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