RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 ARL8AQ96BM9 186 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA8KD6RF30 607 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 HSF2BPO75031 334 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 GPBP1Q86WP2 473 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 SH3GL2Q99962 352 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 CAPS2Q9BXY5 557 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.53■□□□□ 0.88
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SH3BP1-202ENST00000417536 TSKSQ9UJT2 592 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A087X0T9 212 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 OPA1O60313 960 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 PLA2G4BP0C869 781 aa20.53■□□□□ 0.88
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SH3BP1-202ENST00000417536 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 CARSP49589 748 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 PPFIA1Q13136 1202 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 SEPT2Q15019 361 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.53■□□□□ 0.88
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SH3BP1-202ENST00000417536 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.53■□□□□ 0.88
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SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L15C9J2P7 530 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L11C9JVI0 530 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L18D6R9N7 530 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L22D6RA61 530 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L19D6RCP7 530 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L20D6RJB6 530 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 EPS15P42566 896 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L24Q0WX57 530 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 NAB2Q15742 525 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP63Q96MT8 703 aa20.52■□□□□ 0.88
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SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.52■□□□□ 0.88
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SH3BP1-202ENST00000417536 GUCY2DQ02846 1103 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC18A3Q16572 532 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.52■□□□□ 0.88
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SH3BP1-202ENST00000417536 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.52■□□□□ 0.88
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SH3BP1-202ENST00000417536 ADAM9Q13443 819 aa20.52■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 TTMPQ5BVD1 217 aa20.52■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 CAVIN3Q969G5 261 aa20.52■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.52■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM153BP0C7A2 387 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 STAT3P40763 770 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 CORO7P57737 925 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 SNAP25P60880 206 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 GNGT1P63211 74 aa20.51■□□□□ 0.87
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZIM3Q96PE6 472 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM153AQ9UHL3 310 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB5O15062 677 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 HLA-DOAP06340 250 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEA9P43362 315 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 ALS2CLQ60I27 953 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT12Q99456 494 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 GNA14O95837 355 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFRSF8P28908 595 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 BCS1LQ9Y276 419 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 PCNTO95613 3336 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT14P02533 472 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP11B2P19099 503 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 ASIC2Q16515 512 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 HYIQ5T013 277 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 KCTD16Q68DU8 428 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF14Q9UBS8 474 aa20.5■□□□□ 0.87
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