RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398571.6

USP34-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene USP34, Length 11,357 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-201ENST00000398571 PHKBQ93100 1093 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 EDIL3O43854 480 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 LDHBP07195 334 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 PRCPP42785 496 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 SLC1A1P43005 524 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 STRIP1Q5VSL9 837 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 DNAJC19Q96DA6 116 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 BORCS6Q96GS4 357 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 SIKE1Q9BRV8 207 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 STRA6Q9BX79 667 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 FAM204AQ9H8W3 233 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 PES1O00541 588 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 CYTH3O43739 400 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 RARGP13631 454 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 GRM1Q13255 1194 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 CMPK2Q5EBM0 449 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 KCNV1Q6PIU1 500 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 LRRC19Q9H756 370 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 HPCAL4Q9UM19 191 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 BRCA2P51587 3418 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 CHRNA3P32297 505 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 ACAP1Q15027 740 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 PCDHA6Q9UN73 950 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 TRIM66O15016 1216 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 UCHL3P15374 230 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 KIF11P52732 1056 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 HERVK_113P62684 666 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 NR1H3Q13133 447 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 ZNF568Q3ZCX4 644 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 MYOCDQ8IZQ8 938 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 KAT2BQ92831 832 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 AMNQ9BXJ7 453 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 WDR11Q9BZH6 1224 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 KCNQ5Q9NR82 932 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 GOLGA6CA6NDK9 693 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 GOLGA6DP0CG33 693 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 MMP13P45452 471 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 ZDHHC15Q96MV8 337 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 TANGO6Q9C0B7 1094 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 ZBED4O75132 1171 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 PSEN1P49768 467 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 RAPGEF1Q13905 1077 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 BAP1Q92560 729 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 CHP1Q99653 195 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 PDE11AQ9HCR9 933 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 STX8Q9UNK0 236 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 DYTNA2CJ06 578 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.631e-26■■□□□ 12.6
USP34-201ENST00000398571 RXRBP28702 533 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 FBXL18Q96ME1 805 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 RPTORQ8N122 1335 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 FERP16591 822 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 PTPN7P35236 360 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 ADCY2Q08462 1091 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 ICE2Q659A1 982 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 ATL2Q8NHH9 583 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 TEKT1Q969V4 418 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 ASAP1Q9ULH1 1129 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 A0A0G2JS52 829 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 GOLGA6BA6NDN3 693 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 AGTP01019 485 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 CYP7A1P22680 504 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 ECHS1P30084 290 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 PPATQ06203 517 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 RGS9BPQ6ZS82 235 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 HOOK3Q86VS8 718 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 SMC1BQ8NDV3 1235 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 CEP95Q96GE4 821 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 MMS19Q96T76 1030 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 USP40Q9NVE5 1235 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 ABCF2Q9UG63 623 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 HLA-DOAP06340 250 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 ERCC3P19447 782 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 PTENP60484 403 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 WLSQ5T9L3 541 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 LACRTQ9GZZ8 138 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 FAN1Q9Y2M0 1017 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-201ENST00000398571 EML1O00423 815 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms