RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 FBXL16Q8N461 479 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC148Q8NFR7 591 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 AGXT2Q9BYV1 514 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 ZMYND12Q9H0C1 365 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 MTUS1Q9ULD2 1270 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 MEIS1O00470 390 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 CUL9Q8IWT3 2517 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 BACH1O14867 736 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 STAT5BP51692 787 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 PKN1Q16512 942 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 TJAP1Q5JTD0 557 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 NIPA1Q7RTP0 329 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 APBB2Q92870 758 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 PCYT2Q99447 389 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 RRN3P2A6NIE6 340 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 GHRP10912 638 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 INSRRP14616 1297 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 FAM26DQ5JW98 314 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 SPRED2Q7Z698 418 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 IL27Q8NEV9 243 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 BICD2Q8TD16 824 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 DNAJB3Q8WWF6 145 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 INSL6Q9Y581 213 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 FAM86B1E9PN63 330 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 FAM86B2P0C5J1 330 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 SETQ01105 290 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 UIMC1Q96RL1 719 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 OSBPL7Q9BZF2 842 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 VPS54Q9P1Q0 977 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 MTCH2Q9Y6C9 303 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 SIP14410 1827 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 LINC01553A4QN01 128 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 M0QZ92 97 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 CPLX1O14810 134 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 UPP2O95045 317 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 CHRNA1P02708 482 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 IFNAR1P17181 557 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 GRB10Q13322 594 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 FAM160B1Q5W0V3 765 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 RASGRP4Q8TDF6 673 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 GDPD5Q8WTR4 605 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 YME1L1Q96TA2 773 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF577Q9BSK1 485 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 PLCB4Q15147 1175 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 MARCH8Q5T0T0 291 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 KRT40Q6A162 431 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 RPAINQ86UA6 219 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 ZBTB10Q96DT7 871 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 CDY2AQ9Y6F7 541 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 POTEB3A0JP26 581 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 ADAMTS3O15072 1205 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 CYP3A4P08684 503 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 NTRK3Q16288 839 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 POTEBQ6S5H4 581 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 CCNE2O96020 404 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 SLC26A2P50443 739 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 EVCP57679 992 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 NLRP5P59047 1200 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 PRR16Q569H4 304 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 ERVK-21P61565 698 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 MGAT3Q09327 533 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 STK3Q13188 491 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 IER5Q5VY09 327 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 ASB2Q96Q27 587 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 TM6SF1Q9BZW5 370 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF302Q9NR11 478 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 PDRG1Q9NUG6 133 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-202ENST00000378546 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms