RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 NIPA1Q7RTP0 329 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 PPM1EQ8WY54 764 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 RFXAPO00287 272 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 CYP3A4P08684 503 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 PLA2G4DQ86XP0 818 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM22Q8IYM9 498 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 SIP14410 1827 aa26.76■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 A0A0C4DFX4 3053 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 LCHNA4D1U4 455 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 GNA11P29992 359 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 FAM26DQ5JW98 314 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 MARCH8Q5T0T0 291 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC148Q8NFR7 591 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 ZBED2Q9BTP6 218 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 EPOPA6NHQ4 379 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 CPLX1O14810 134 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 GJB5O95377 273 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 FAM117BQ6P1L5 589 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 SPRED2Q7Z698 418 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 BICD2Q8TD16 824 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 UIMC1Q96RL1 719 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 AZI2Q9H6S1 392 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 PRDM6Q9NQX0 595 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 SH3GLB2Q9NR46 395 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 ATG7O95352 703 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 CCNE2O96020 404 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 INSRRP14616 1297 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 IGBP1P78318 339 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 TAF2Q6P1X5 1199 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 RPAINQ86UA6 219 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 ARNTL2Q8WYA1 636 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 SEPT8Q92599 483 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 ZBTB10Q96DT7 871 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 CDKL5O76039 1030 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 CHRNA1P02708 482 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 STAT5BP51692 787 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 PLCB4Q15147 1175 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 DNAJB3Q8WWF6 145 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 RRN3P2A6NIE6 340 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 DHX15O43143 795 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 MGAT3Q09327 533 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 STK3Q13188 491 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 RAD9AQ99638 391 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 TRPC6Q9Y210 931 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 AMHP03971 560 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 ABHD15Q6UXT9 468 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 MYOCDQ8IZQ8 938 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-201ENST00000378543 DEXIO95424 95 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 NLRP5P59047 1200 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 RSPH3Q86UC2 560 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF577Q9BSK1 485 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 CUL9Q8IWT3 2517 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 EDIL3O43854 480 aa26.69■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 GHRP10912 638 aa26.69■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 CIITAP33076 1130 aa26.69■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 SETQ01105 290 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 MICALL1Q8N3F8 863 aa26.69■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa26.69■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 POTEB3A0JP26 581 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 BACH1O14867 736 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 PFKFB2O60825 505 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 PRR16Q569H4 304 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 POTEBQ6S5H4 581 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 APBB2Q92870 758 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 MTCH2Q9Y6C9 303 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 CDY2AQ9Y6F7 541 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 WDR81Q562E7 1941 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 LINC01553A4QN01 128 aa26.67■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 SLC26A2P50443 739 aa26.67■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 LPIN1Q14693 890 aa26.67■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 FAM160B1Q5W0V3 765 aa26.67■■□□□ 1.86
FAAP20-201ENST00000378543 KRT40Q6A162 431 aa26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms