RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361786.6

CIPC-201, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CIPC, Length 4,486 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-201ENST00000361786 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.94□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.94□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 MTFR1LQ9H019 292 aa14.94□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 HACL1Q9UJ83 578 aa14.94□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 SLC16A4O15374 487 aa14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 FCER1AP12319 257 aa14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 JAK3P52333 1124 aa14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 ARID5BQ14865 1188 aa14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 BSPRYQ5W0U4 402 aa14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 ACER1Q8TDN7 264 aa14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 LXNQ9BS40 222 aa14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 CTDNEP1O95476 244 aa14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 LRRC63Q05C16 580 aa14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 STIM2Q9P246 746 aa14.93□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 INPP5BP32019 993 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 HPS3Q969F9 1004 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 ECE1P42892 770 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 USP11P51784 963 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 RAD54LQ92698 747 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 MYO1FO00160 1098 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 TUBB2AQ13885 445 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 LPAR1Q92633 364 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.92□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 ZNF233A6NK53 670 aa14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 ZNF394Q53GI3 561 aa14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 IFT20Q8IY31 132 aa14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 NEDD9Q14511 834 aa14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 MMP19Q99542 508 aa14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 TSKSQ9UJT2 592 aa14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 KRIT1O00522 736 aa14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 THAP12O43422 761 aa14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 MYL3P08590 195 aa14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 FERP16591 822 aa14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 COASYQ13057 564 aa14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.91□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 CLDN3O15551 220 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 RNF8O76064 485 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 VSTM4Q8IW00 320 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 EXOC8Q8IYI6 725 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 SLC35F6Q8N357 371 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 THAP9Q9H5L6 903 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 DENND3A2RUS2 1198 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 FDX1P10109 184 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 BPIFB4P59827 614 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 TTLL4Q14679 1199 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 NAA25Q14CX7 972 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 MAPK6Q16659 721 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 CASC4Q6P4E1 433 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 ATG4CQ96DT6 458 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 GRIN3BO60391 1043 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 GAS8O95995 478 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 GCLMP48507 274 aa14.9□□□□□ -0.02
CIPC-201ENST00000361786 ZBED6P86452 979 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms