RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 COPB2P35606 906 aa20.62■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 TXKP42681 527 aa20.62■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 ASIC2Q16515 512 aa20.62■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 CALML4Q96GE6 196 aa20.62■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 YIPF3Q9GZM5 350 aa20.62■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.62■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 KIF5BP33176 963 aa20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 CEP120Q8N960 986 aa20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 GSTA1P08263 222 aa20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 GYG1P46976 350 aa20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 UNC13DQ70J99 1090 aa20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 AZI2Q9H6S1 392 aa20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.61■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 NQO1P15559 274 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 PRPHP41219 470 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 ERICH1Q86X53 443 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 SAAL1Q96ER3 474 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 AK8Q96MA6 479 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 FMO2Q99518 471 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 NR2E1Q9Y466 385 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 PTK2Q05397 1052 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 LRRC63Q05C16 580 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 GRB10Q13322 594 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 RIPK1Q13546 671 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 DAAM2Q86T65 1068 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 TSG101Q99816 390 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 MYH3P11055 1940 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 ACTN1P12814 892 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 NCALDP61601 193 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 PEX26Q7Z412 305 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 KCNV2Q8TDN2 545 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 ECT2Q9H8V3 914 aa20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 COL18A1P39060 1754 aa20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 ASAP2O43150 1006 aa20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.896e-25■■■□□ 17.2
PRPF39-201ENST00000355765 SLCO1A2P46721 670 aa20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 ITIH4Q14624 930 aa20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 LAD1O00515 517 aa20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 CENPTQ96BT3 561 aa20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 ABCB11O95342 1321 aa20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 AFF2P51816 1311 aa20.59■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 CFAP73A6NFT4 308 aa20.58■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.58■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 PNMA1Q8ND90 353 aa20.58■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.58■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.58■□□□□ 0.89
PRPF39-201ENST00000355765 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.58■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 STXBP3O00186 592 aa20.58■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 CYTH3O43739 400 aa20.58■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 FGRP09769 529 aa20.58■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 RARAP10276 462 aa20.58■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC38Q502W7 563 aa20.58■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 HOOK3Q86VS8 718 aa20.58■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.58■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.58■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF384Q8TF68 577 aa20.58■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.58■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.58■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.58■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 CES2O00748 559 aa20.57■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 AP1G2O75843 785 aa20.57■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 KRT16P08779 473 aa20.57■□□□□ 0.88
PRPF39-201ENST00000355765 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms