RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM47Q96LD4 638 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 WRNIP1Q96S55 665 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 A6NNZ2 444 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 USP14P54578 494 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 ERMNQ8TAM6 284 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 THAP9Q9H5L6 903 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 PLA2G4BP0C869 781 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 HSD17B4P51659 736 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 UBXN2AP68543 259 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 SPP2Q13103 211 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 FZD1Q9UP38 647 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 STK24Q9Y6E0 443 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 BICDL2A1A5D9 508 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 FLOT1O75955 427 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 IDEP14735 1019 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 GSCP56915 257 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 AMPD2Q01433 879 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 EHHADHQ08426 723 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM14Q14142 442 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 MTF1Q14872 753 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 SLC35F6Q8N357 371 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 PICK1Q9NRD5 415 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 POTEFA5A3E0 1075 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 POTEIP0CG38 1075 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 PTPRAP18433 802 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 POTEGQ6S5H5 508 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 VPS16Q9H269 839 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 MYO6Q9UM54 1294 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 NFIBO00712 420 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 N4BP3O15049 544 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 RPA1P27694 616 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 BACE1P56817 501 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 GBP6Q6ZN66 633 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 CPXCR1Q8N123 301 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 RUBCNQ92622 972 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 GHRHRQ02643 423 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 RBL2Q08999 1139 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 COASYQ13057 564 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 PSMD2Q13200 908 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 GPBP1Q86WP2 473 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 SLC5A5Q92911 643 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 EML1O00423 815 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 ALAS1P13196 640 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 SLC12A3P55017 1021 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 CEP55Q53EZ4 464 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 CENPPQ6IPU0 288 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 DRC1Q96MC2 740 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 COL20A1Q9P218 1284 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 RPTORQ8N122 1335 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 CYP11B2P19099 503 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 COG1Q8WTW3 980 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 KLRG1Q96E93 195 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 PANK4Q9NVE7 773 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms