RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 TCHHQ07283 1943 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 LGR5O75473 907 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 CABYRO75952 493 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 F2P00734 622 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 SNX17Q15036 470 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 PTPAQ15257 358 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 PCYT2Q99447 389 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 DISC1Q9NRI5 854 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 SAMM50Q9Y512 469 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 PSAPP07602 524 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 ATL3Q6DD88 541 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 TRIM50Q86XT4 487 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 KAT2BQ92831 832 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 ARID2Q68CP9 1835 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 POTEMA6NI47 508 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 EML1O00423 815 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 AZI2Q9H6S1 392 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 HAS3O00219 553 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 YEATS4O95619 227 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 TECP42680 631 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 TRIM60Q495X7 471 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF302Q9NR11 478 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 H3BRB1 525 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 BACH1O14867 736 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 PSEN2P49810 448 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 PSMC6P62333 389 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 MFSD10Q14728 455 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 EPHA7Q15375 998 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 IL17AQ16552 155 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 GLG1Q92896 1179 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 RAB34Q9BZG1 259 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.69■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 STAT5BP51692 787 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC39A14Q15043 492 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 UGCGQ16739 394 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 NEK9Q8TD19 979 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 CFAP45Q9UL16 551 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 KAT6AQ92794 2004 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 GRIN2DO15399 1336 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 LTBP2Q14767 1821 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC26A2P50443 739 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 ITGA7Q13683 1181 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 STK38Q15208 465 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 MARK3P27448 753 aa22.66■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 KRT85P78386 507 aa22.66■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 PDIA5Q14554 519 aa22.66■■□□□ 1.22
RALGPS1-202ENST00000319107 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms