RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 HTATIP2Q9BUP3 242 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 GABBR1Q9UBS5 961 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 CEP131Q9UPN4 1083 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 HAS3O00219 553 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM266Q2M3C6 531 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 C7orf31Q8N865 590 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 POTEMA6NI47 508 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 BMP15O95972 392 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 RTP1P59025 263 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM60Q495X7 471 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 PDXDC2PQ6P474 469 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 USP28Q96RU2 1077 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 DDIT3P35638 169 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 PRPHP41219 470 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 SNX17Q15036 470 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 NFRKBQ6P4R8 1299 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 RNPEPQ9H4A4 650 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 RGS19P49795 217 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 CDK7P50613 346 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 NUCB2P80303 420 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 EPHA7Q15375 998 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 C1orf53Q5VUE5 145 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 SLC43A3Q8NBI5 491 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 BANK1Q8NDB2 785 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 MROH7Q68CQ1 1323 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 SLC26A2P50443 739 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 UGCGQ16739 394 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 TRPC6Q9Y210 931 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 TLE2Q04725 743 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 PLCB4Q15147 1175 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 IL17AQ16552 155 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 DPF3Q92784 378 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 RAB34Q9BZG1 259 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 POTEB3A0JP26 581 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 VWA3AA6NCI4 1184 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 CYP4A11Q02928 519 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 PTPAQ15257 358 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 POTEBQ6S5H4 581 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 DYDC2Q96IM9 177 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
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HOXD4-201ENST00000306324 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD4-201ENST00000306324 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa25.09■■□□□ 1.61
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HOXD4-201ENST00000306324 QARSP47897 775 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 PSMC5P62195 406 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 SESTD1Q86VW0 696 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
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HOXD4-201ENST00000306324 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF862O60290 1169 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 EVI5O60447 810 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 PRKCEQ02156 737 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 PPFIA1Q13136 1202 aa25.07■■□□□ 1.6
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HOXD4-201ENST00000306324 PDIA5Q14554 519 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 STK38Q15208 465 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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HOXD4-201ENST00000306324 C7orf61Q8IZ16 206 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 ERMNQ8TAM6 284 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 ATP8B4Q8TF62 1192 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 LXNQ9BS40 222 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 TRPV6Q9H1D0 765 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 SETD4Q9NVD3 440 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 C17orf102A2RUQ5 167 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 B4GALT4O60513 344 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 TPH2Q8IWU9 490 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 TOX2Q96NM4 488 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD4-201ENST00000306324 NOD1Q9Y239 953 aa25.06■■□□□ 1.6
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