RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 RBSNQ9H1K0 784 aa23.14■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 ARIH2O95376 493 aa23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 EYA4O95677 639 aa23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 GGPS1O95749 300 aa23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 TBC1D8O95759 1140 aa23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC12A3P55017 1021 aa23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMC5P62195 406 aa23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 ASIC1P78348 528 aa23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 MORC3Q14149 939 aa23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 LY6KQ17RY6 165 aa23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 METTL7BQ6UX53 244 aa23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 APBA2Q99767 749 aa23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 BHMT2Q9H2M3 363 aa23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF214Q8ND24 703 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 GJD2Q9UKL4 321 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 MYMKA6NI61 221 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 LYPLA2O95372 231 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 CTGFP29279 349 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMC4P43686 418 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 GPBP1Q86WP2 473 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX12PQ92771 950 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 KATNBL1Q9H079 304 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 PDGFCQ9NRA1 345 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF186Q9NXI6 227 aa23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.11■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 TRPA1O75762 1119 aa23.11■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF165P49910 485 aa23.11■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNB1Q14721 858 aa23.11■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 TAPT1Q6NXT6 567 aa23.11■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.11■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 C4orf19Q8IY42 314 aa23.11■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.11■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP2B6P20813 491 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 BMP6P22004 513 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 SP3Q02447 781 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 UGCGQ16739 394 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 DYMQ7RTS9 669 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM47Q96LD4 638 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 KLRC4O43908 158 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 ATG7O95352 703 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP11B2P19099 503 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 MRE11P49959 708 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF22Q14807 665 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 DACH1Q9UI36 760 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 BACH1O14867 736 aa23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 ACVR2BQ13705 512 aa23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 KMT5BQ4FZB7 885 aa23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 MLKLQ8NB16 471 aa23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 EXOC1Q9NV70 894 aa23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB39O15060 712 aa23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 RHOBTB3O94955 611 aa23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT18P05783 430 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 IRF5Q13568 498 aa23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 UNC13DQ70J99 1090 aa23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.08■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 ADCYAP1R1P41586 468 aa23.08■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.08■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA33Q96N06 139 aa23.08■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 IDEP14735 1019 aa23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 CCL14Q16627 93 aa23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 ARSHQ5FYA8 562 aa23.07■■□□□ 1.28
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