RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM192Q8IY95 271 aa22.42■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 ANO3Q9BYT9 981 aa22.42■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 AZI2Q9H6S1 392 aa22.42■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 H3BNC9 293 aa22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 ARP10275 920 aa22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 GPM6BQ13491 265 aa22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 PTPROQ16827 1216 aa22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 IL17RAQ96F46 866 aa22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 SDF4Q9BRK5 362 aa22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.41■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 NFASCO94856 1347 aa22.4■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 SMCO2A6NFE2 343 aa22.4■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.4■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 STXBP3O00186 592 aa22.4■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 ACTR2P61160 394 aa22.4■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 KRT32Q14532 448 aa22.4■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 CEP55Q53EZ4 464 aa22.4■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.4■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM260Q9NX78 707 aa22.4■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 BARHL2Q9NY43 387 aa22.4■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 TRPC6Q9Y210 931 aa22.4■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 NCOR1O75376 2440 aa22.39■■□□□ 1.18
CXCL3-201ENST00000296026 ENPP3O14638 875 aa22.39■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 CDC45O75419 566 aa22.39■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 CDC27P30260 824 aa22.39■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 FIBCD1Q8N539 461 aa22.39■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.39■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.39■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 KCNA5P22460 613 aa22.38■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 SREBF1P36956 1147 aa22.38■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 STAT5BP51692 787 aa22.38■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 AP3B2Q13367 1082 aa22.38■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 PLCB4Q15147 1175 aa22.38■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.38■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.38■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.38■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.38■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 MEIS1O00470 390 aa22.37■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 RCAN1P53805 252 aa22.37■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.37■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 IER5Q5VY09 327 aa22.37■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 BANK1Q8NDB2 785 aa22.37■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.37■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.37■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.37■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.36■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 CD52P31358 61 aa22.36■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 CTNNB1P35222 781 aa22.36■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF76P36508 570 aa22.36■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 FGD1P98174 961 aa22.36■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.36■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.36■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.36■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.36■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 POTEB3A0JP26 581 aa22.35■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 M0QZ92 97 aa22.35■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 ATG7O95352 703 aa22.35■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 CPA1P15085 419 aa22.35■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.35■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.35■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 POTEBQ6S5H4 581 aa22.35■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 SQORQ9Y6N5 450 aa22.35■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.34■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 CCNE2O96020 404 aa22.34■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 RB1P06400 928 aa22.34■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 LINC00271P0C7V0 271 aa22.34■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 BMPR1AP36894 532 aa22.34■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 APOBRQ0VD83 1088 aa22.34■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.34■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.34■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.34■■□□□ 1.17
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