RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 RHBDL3P58872 404 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 LRIG3Q6UXM1 1119 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 MICALCLQ6ZW33 695 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 NT5C3AQ9H0P0 336 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 EMILIN3Q9NT22 766 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 MTMR4Q9NYA4 1195 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PCDHA12Q9UN75 941 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 NFS1Q9Y697 457 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 MYO1FO00160 1098 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 SNHG28P0DPA3 235 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 EPS15P42566 896 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 DNAAF5Q86Y56 855 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 LRRC57Q8N9N7 239 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ACTRT1Q8TDG2 376 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PBKQ96KB5 322 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 JMJD4Q9H9V9 463 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 MYH7BA7E2Y1 1941 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 MARCH6O60337 910 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 HPDP32754 393 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 CUL1Q13616 776 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 C10orf76Q5T2E6 689 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 GPBP1Q86WP2 473 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 OR2W6PQ8NHA6 318 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 UIMC1Q96RL1 719 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 NEUROG2Q9H2A3 272 aa16.35■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 CEP104O60308 925 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 FAM107AO95990 144 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 CYP11B2P19099 503 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 SLC9A1P19634 815 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 EIF6P56537 245 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PTPROQ16827 1216 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 POTEB3A0JP26 581 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 GOLGA6L10A6NI86 522 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 POTECB2RU33 542 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 E7EVH7 732 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 GRAPQ13588 217 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 POTEBQ6S5H4 581 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 BARGINQ6ZT62 677 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 CLEC10AQ8IUN9 316 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ADGRF4Q8IZF3 695 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 AP1M1Q9BXS5 423 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 CENPHQ9H3R5 247 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 NAGPAQ9UK23 515 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16.34■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa16.33■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PLIN4Q96Q06 1357 aa16.33■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 CETN3O15182 167 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 MYZAPP0CAP1 466 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 PLCG2P16885 1265 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 NR2F2P24468 414 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 ZNF844Q08AG5 666 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 METTL13Q8N6R0 699 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 CUL5Q93034 780 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 CD209Q9NNX6 404 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 H0YHG0 523 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 SART1O43290 800 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 RPS6KA4O75676 772 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 UCHL3P15374 230 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 USP8P40818 1118 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 CASP5P51878 434 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 MNAT1P51948 309 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 ARSHQ5FYA8 562 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 LRRC45Q96CN5 670 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 KIF13BQ9NQT8 1826 aa16.33■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 AKR1B1P15121 316 aa16.32■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 TTBK2Q6IQ55 1244 aa16.32■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.32■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 TPCN2Q8NHX9 752 aa16.32■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 SPAG5Q96R06 1193 aa16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms