RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640888.1

LIAS-222, Transcript of lipoic acid synthetase, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIAS, Length 4,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIAS-222	ENST00000640888	PNMA2	Q9UL42	364 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	HMGCS2	P54868	508 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	ZBED6	P86452	979 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	CENPP	Q6IPU0	288 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	REEP2	Q9BRK0	252 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	MYH8	P13535	1937 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	SLC26A4	O43511	780 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	PSMC6	P62333	389 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	BANK1	Q8NDB2	785 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	IQCD	Q96DY2	449 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	NFIB	O00712	420 aa		10.77	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	EYA4	O95677	639 aa		10.77	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	EGFR	P00533	1210 aa		10.77	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	KIF5A	Q12840	1032 aa		10.77	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		10.77	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	ODR4	Q5SWX8	454 aa		10.77	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	WDR78	Q5VTH9	848 aa		10.77	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		10.77	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		10.77	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	RMDN3	Q96TC7	470 aa		10.77	□□□□□ -0.68
LIAS-222	ENST00000640888	GAP43	P17677	238 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	NLRX1	Q86UT6	975 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	RNF146	Q9NTX7	359 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	PIK3CD	O00329	1044 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	NDUFA10	O95299	355 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	VCAM1	P19320	739 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	CIITA	P33076	1130 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	KLK7	P49862	253 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	MMP14	P50281	582 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	DGKZ	Q13574	1117 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	MTMR1	Q13613	665 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	SULF1	Q8IWU6	871 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	PARVG	Q9HBI0	331 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	CSAD	Q9Y600	493 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	SCN9A	Q15858	1988 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	CLIC2	O15247	247 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	LXN	Q9BS40	222 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	CYP3A4	P08684	503 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	AR	P10275	920 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	ATG4C	Q96DT6	458 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	CEP63	Q96MT8	703 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	CHP1	Q99653	195 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	FZD1	Q9UP38	647 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	EML1	O00423	815 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	NF2	P35240	595 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	CYP2J2	P51589	502 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	DRC1	Q96MC2	740 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	WDR24	Q96S15	920 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	BACH1	O14867	736 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	SORBS3	O60504	671 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	PBX1	P40424	430 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	EPHA7	Q15375	998 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
LIAS-222	ENST00000640888	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69

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