RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626583.2

LINC01828-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1828, human

TSL 5

Gene LINC01828, Length 848 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01828-208	ENST00000626583	GRM6	O15303	877 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	LILRB5	O75023	590 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	LRRN2	O75325	713 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	GJB5	O95377	273 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	IL2RA	P01589	272 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	TNP2	Q05952	138 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	NFIA	Q12857	509 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	SPP2	Q13103	211 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	LAMC2	Q13753	1193 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	SIX5	Q8N196	739 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	POM121	Q96HA1	1249 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	CTAGE5	O15320	804 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	NCK2	O43639	380 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	CYP2C9	P11712	490 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	ACTN1	P12814	892 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	IL1R1	P14778	569 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	ALAS2	P22557	587 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	CAMK1	Q14012	370 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	GPNMB	Q14956	572 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	FAM151A	Q8WW52	585 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	RAD9A	Q99638	391 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	HCN2	Q9UL51	889 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	RAX	Q9Y2V3	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	EML5	Q05BV3	1969 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	CACNA1E	Q15878	2313 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	PFKM	P08237	780 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	FAM157B	P0CG42	384 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	ADORA2A	P29274	412 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	CSRP2	Q16527	193 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LINC01828-208	ENST00000626583	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.34	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	BSN	Q9UPA5	3926 aa		4.34	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	FAM196B	A6NMK8	535 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	EFCAB14	O75071	495 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	SIN3B	O75182	1162 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	KRT10	P13645	584 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	NID1	P14543	1247 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	PTGS1	P23219	599 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	PHKA2	P46019	1235 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	KCNJ6	P48051	423 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	LIMK1	P53667	647 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	CFHR1	Q03591	330 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	SCAP	Q12770	1279 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	NR1H3	Q13133	447 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LINC01828-208	ENST00000626583	MCM10	Q7L590	875 aa		4.33	□□□□□ -1.72

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