RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 IQUBQ8NA54 791 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 SMARCE1Q969G3 411 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 DYNLL2Q96FJ2 89 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 CEP95Q96GE4 821 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 RAB34Q9BZG1 259 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 USP40Q9NVE5 1235 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF358Q9NW07 568 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 PI4KBQ9UBF8 816 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 OFD1O75665 1012 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 PDHBP11177 359 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 NAPAP54920 295 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 TMEM179Q6ZVK1 233 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 CERS5Q8N5B7 392 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 AOPEPQ8N6M6 819 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 NUDT8Q8WV74 236 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 SPTLC3Q9NUV7 552 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 NYAP2Q9P242 653 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 CCP110O43303 1012 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 SHMT1P34896 483 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF543Q08ER8 600 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 PICALMQ13492 652 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 ILDR2Q71H61 639 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 NEK8Q86SG6 692 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 TTLL6Q8N841 843 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC112Q8NEF3 446 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 BHMTQ93088 406 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 MKL1Q969V6 931 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 CEP63Q96MT8 703 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 CSRNP2Q9H175 543 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 SH2D4AQ9H788 454 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 KANSL2Q9H9L4 492 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 TUBB4AP04350 444 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 TPM2P07951 284 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 ADCY7P51828 1080 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 SPAG1Q07617 926 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 AP3B2Q13367 1082 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 DRC7Q8IY82 874 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 SHISA4Q96DD7 197 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 KCND1Q9NSA2 647 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 GINM1Q9NU53 330 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.22□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.21□□□□□ -0.94
CTXN3-204ENST00000620385 SMIM22K7EJ46 135 aa9.21□□□□□ -0.94
CTXN3-204ENST00000620385 PIK3CDO00329 1044 aa9.21□□□□□ -0.94
CTXN3-204ENST00000620385 PPIP5K2O43314 1243 aa9.21□□□□□ -0.94
CTXN3-204ENST00000620385 CYTH3O43739 400 aa9.21□□□□□ -0.94
CTXN3-204ENST00000620385 OR52Z1P0C646 297 aa9.21□□□□□ -0.94
CTXN3-204ENST00000620385 TGFB2P61812 414 aa9.21□□□□□ -0.94
CTXN3-204ENST00000620385 MORC3Q14149 939 aa9.21□□□□□ -0.94
CTXN3-204ENST00000620385 MCM6Q14566 821 aa9.21□□□□□ -0.94
CTXN3-204ENST00000620385 LONRF3Q496Y0 759 aa9.21□□□□□ -0.94
CTXN3-204ENST00000620385 MSL1Q68DK7 614 aa9.21□□□□□ -0.94
CTXN3-204ENST00000620385 MOXD1Q6UVY6 613 aa9.21□□□□□ -0.94
CTXN3-204ENST00000620385 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CTXN3-204ENST00000620385 TNS4Q8IZW8 715 aa9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms