RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 IFT81Q8WYA0 676 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TATDN2Q93075 761 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CSRNP2Q9H175 543 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 XDHP47989 1333 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 SNAP23O00161 211 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PRDM1O75626 825 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 RPS6KA3P51812 740 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TFAP4Q01664 338 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 GRIK3Q13003 919 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 SEC23AQ15436 765 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PTGISQ16647 500 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TMC4Q7Z404 712 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 BLIDQ8IZY5 108 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 FUKQ8N0W3 1084 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 HVCN1Q96D96 273 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 C8orf37Q96NL8 207 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TRIM7Q9C029 511 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 STXBP3O00186 592 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CASP14P31944 242 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 NR5A1Q13285 461 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC96Q2M329 555 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 MAB21L3Q8N8X9 362 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 VCX3BQ9H321 246 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CUEDC2Q9H467 287 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 NOD2Q9HC29 1040 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 SENP2Q9HC62 589 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TSKSQ9UJT2 592 aa6.54□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TNNC1P63316 161 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 GRAPQ13588 217 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 KCNB1Q14721 858 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TAF11Q15544 211 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 GNPTABQ3T906 1256 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 RGL1Q9NZL6 768 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PSMA7O14818 248 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PDHBP11177 359 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 MCM7P33993 719 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 MORC3Q14149 939 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TBC1D9BQ66K14 1250 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 WHAMMQ8TF30 809 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CALML4Q96GE6 196 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 STIM2Q9P246 746 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 GGA1Q9UJY5 639 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 SLX4Q8IY92 1834 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 BICDL2A1A5D9 508 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 KCNH2Q12809 1159 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 MTF1Q14872 753 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 RNF135Q8IUD6 432 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.53□□□□□ -1.36
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