RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 BTBD11A6QL63 1104 aa6.33□□□□□ -1.4
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PRPF39-212ENST00000557477 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF39-212ENST00000557477 MPOP05164 745 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF39-212ENST00000557477 ERVK-21P61565 698 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF39-212ENST00000557477 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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PRPF39-212ENST00000557477 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF39-212ENST00000557477 TERF2Q15554 542 aa6.29□□□□□ -1.4
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