RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 GANQ9H2C0 597 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 FAM114A2Q9NRY5 505 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 MCM9Q9NXL9 1143 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 MINPP1Q9UNW1 487 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.56□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 NHSQ6T4R5 1651 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 KLRF2D3W0D1 207 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 SLC8A1P32418 973 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 ELF1P32519 619 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 EVX2Q03828 476 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 PPP2R5EQ16537 467 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 TBCKQ8TEA7 893 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 LMBR1Q8WVP7 490 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 TATDN2Q93075 761 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.55□□□□□ -0.569e-7■■□□□ 12.9
CS-202ENST00000542324 NLRC4Q9NPP4 1024 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 INTUQ9ULD6 942 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 CEP83Q9Y592 693 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 ZNF831Q5JPB2 1677 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 A0A087X0T9 212 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 GSTA1P08263 222 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 FAM228BP0C875 321 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 TSPY3P0CV98 308 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 TSPY8P0CW00 308 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 NF2P35240 595 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 NPEPPSP55786 919 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 COASYQ13057 564 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 RAPGEF1Q13905 1077 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 FAM26FQ5R3K3 315 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 HYIQ5T013 277 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 KRT79Q5XKE5 535 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 CYB5D1Q6P9G0 228 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 TMC4Q7Z404 712 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 KLHL7Q8IXQ5 586 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 FUKQ8N0W3 1084 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 LRRC57Q8N9N7 239 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 CCDC26Q8TAB7 109 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 DDX12PQ92771 950 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 TMEM47Q9BQJ4 181 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 ANKRD2Q9GZV1 360 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 MKNK2Q9HBH9 465 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP11.55□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 TRAF5O00463 557 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 KCNK3O14649 394 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 GFPT2O94808 682 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 USP17L8P0C7I0 530 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 HPDP32754 393 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 PRKCIP41743 596 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 EDRF1Q3B7T1 1238 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 CLEC4GQ6UXB4 293 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 SLFN11Q7Z7L1 901 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 CROCCP2Q86T23 111 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 SYCE1Q8N0S2 351 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 TLCD1Q96CP7 247 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 OSBPL7Q9BZF2 842 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 CD248Q9HCU0 757 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 NENFQ9UMX5 172 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 EZRP15311 586 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 TXKP42681 527 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 CRKLP46109 303 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 ATP2B2Q01814 1243 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 CLUL1Q15846 466 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 DYMQ7RTS9 669 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 TMC3Q7Z5M5 1100 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 HOOK3Q86VS8 718 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 RAPGEF5Q92565 580 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 NT5C3AQ9H0P0 336 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 FBXL5Q9UKA1 691 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 LEMD3Q9Y2U8 911 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-202ENST00000542324 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.6 ms