RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 C16orf59Q7L2K0 433 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 STK32CQ86UX6 486 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 TTLL11Q8NHH1 800 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 TOX2Q96NM4 488 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 ALG1Q9BT22 464 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 CD244Q9BZW8 370 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC66A2RUB6 948 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 FAM90A27PA6NNH2 459 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM13O60858 407 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 EFCAB14O75071 495 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 ASMTLO95671 621 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 GNAT1P11488 350 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 ITGA1P56199 1179 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 GRIN1Q05586 938 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 ADAM9Q13443 819 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF460Q14592 562 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 CHRNA2Q15822 529 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF385BQ569K4 471 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 PRR31Q5SQ13 230 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 OVCH1Q7RTY7 1134 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 FBXW5Q969U6 566 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 DSEQ9UL01 958 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 COQ6Q9Y2Z9 468 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 CD2APQ9Y5K6 639 aa5.66□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 RFPL3O75679 317 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 MECP2P51608 486 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 SPIRE1Q08AE8 756 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 GPR19Q15760 415 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 CIAPIN1Q6FI81 312 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 LIPIQ6XZB0 460 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 SIAH1Q8IUQ4 282 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 FANCLQ9NW38 375 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 DTLQ9NZJ0 730 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 SRPK3Q9UPE1 567 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 ABCC8Q09428 1581 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 DNMBPQ6XZF7 1577 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 SH3D21A4FU49 640 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 KRIT1O00522 736 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 KCNK3O14649 394 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 CYP2C8P10632 490 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 KCTD1Q719H9 257 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC88BA6NC98 1476 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 FAHP16930 419 aa5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 DNM2P50570 870 aa5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 C16orf86Q6ZW13 317 aa5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 NOSTRINQ8IVI9 506 aa5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 IGSF22Q8N9C0 903 aa5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 KCNC2Q96PR1 638 aa5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 CATSPERZQ9NTU4 200 aa5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 RFXAPO00287 272 aa5.62□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 TRAF5O00463 557 aa5.62□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 COL6A1P12109 1028 aa5.62□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 TCERG1LQ5VWI1 586 aa5.62□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 HOMER1Q86YM7 354 aa5.62□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.62□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 DTX3Q8N9I9 347 aa5.62□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 KYQ8NBH2 561 aa5.62□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 SYT8Q8NBV8 401 aa5.62□□□□□ -1.51
CLVS1-209ENST00000522928 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms