RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF536	O15090	1300 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	KCNK3	O14649	394 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	IL18BP	O95998	194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	AMY2A	P04746	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PYGM	P11217	842 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	INSRR	P14616	1297 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	AMY2B	P19961	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	EPHA5	P54756	1037 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SERINC3	Q13530	473 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	RASA3	Q14644	834 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	CBLC	Q9ULV8	474 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	B4GALT4	O60513	344 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	KLHL18	O94889	574 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	KNG1	P01042	644 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	KRT15	P19012	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ADAM17	P78536	824 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	RBL2	Q08999	1139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PAK1	Q13153	545 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	CRTAM	O95727	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PDE6A	P16499	860 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	JAM2	P57087	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	GPR20	Q99678	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ARVCF	O00192	962 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	AQP7	O14520	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	GPR42	O15529	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	CYP7B1	O75881	506 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	DNM2	P50570	870 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PPP2CB	P62714	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PPP2CA	P67775	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ICAM4	Q14773	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SEC23A	Q15436	765 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	GPR19	Q15760	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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