RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 MREGQ8N565 214 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 JAKMIP2Q96AA8 810 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 KCNH3Q9ULD8 1083 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 WDR37Q9Y2I8 494 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 FAM205CA6NFA0 338 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 ATP2C2O75185 946 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 TAF11Q15544 211 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 LAMB1P07942 1786 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 TEX33O43247 280 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 FGRP09769 529 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 NAT1P18440 290 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 C2orf54Q08AI8 447 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 MYBPC2Q14324 1141 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 PKN1Q16512 942 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 GALNT17Q6IS24 598 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 SESTD1Q86VW0 696 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 KIFAP3Q92845 792 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 NDNQ99608 321 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 SBF2Q86WG5 1849 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 MAST2Q6P0Q8 1798 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 IRS2Q9Y4H2 1338 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 FOXN1O15353 648 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 GYPCP04921 128 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 USP17L8P0C7I0 530 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 XBP1P17861 261 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 STAT6P42226 847 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.939e-8■■■□□ 15.4
TRPS1-209ENST00000519674 FUT2Q10981 343 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 GRAPQ13588 217 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 PPP2R5BQ15173 497 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 MTRQ99707 1265 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 HAUS4Q9H6D7 363 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
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TRPS1-209ENST00000519674 TSPY2A6NKD2 308 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 CASP14P31944 242 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 CFAP58Q5T655 872 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa9.25□□□□□ -0.93
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TRPS1-209ENST00000519674 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
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TRPS1-209ENST00000519674 PTPREP23469 700 aa9.25□□□□□ -0.93
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TRPS1-209ENST00000519674 PAK2Q13177 524 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 GRIK5Q16478 980 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 MED15Q96RN5 788 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 STIM2Q9P246 746 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 TRIM10Q9UDY6 481 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 DLEC1Q9Y238 1755 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 F8W031 263 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-209ENST00000519674 ORC4O43929 436 aa9.25□□□□□ -0.93
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