RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516123.1

SNORD116-28-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 116-28, humanhuman

BASIC

Gene SNORD116-28, Length 91 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD116-28-201ENST00000516123 WASF3Q9UPY6 502 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 CPP00450 1065 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 CKMP06732 381 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 HOXC12P31275 282 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 ECI1P42126 302 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 GIPRP48546 466 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 NCAPHQ15003 741 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 PHF19Q5T6S3 580 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 Q6ZSN1 163 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 CCDC103Q8IW40 242 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 PPIL6Q8IXY8 311 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 STPG3Q8N7X2 389 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 RCBTB1Q8NDN9 531 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 AGAP2Q99490 1192 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 BCL2L13Q9BXK5 485 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 PARPBPQ9NWS1 579 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 RBPJLQ9UBG7 517 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 NR2E1Q9Y466 385 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 TMEM191CA6NGB0 347 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 PLSCR1O15162 318 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 CYP27B1O15528 508 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 KCNJ6P48051 423 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 TESK1Q15569 626 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 PROSER1Q86XN7 944 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 GIPC2Q8TF65 315 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 BTN2A2Q8WVV5 523 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 SCYL1Q96KG9 808 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 MRGPRX3Q96LB0 322 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 KCND1Q9NSA2 647 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 GINM1Q9NU53 330 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 FBXL7Q9UJT9 491 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD116-28-201ENST00000516123 PEX11BO96011 259 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 SCG5P05408 212 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 ITGAVP06756 1048 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 BMP5P22003 454 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 POLD1P28340 1107 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 SOX9P48436 509 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 CASP7P55210 303 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 GRIN1Q05586 938 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 CCDC27Q2M243 656 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF394Q53GI3 561 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 FNDC7Q5VTL7 733 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 LRCH2Q5VUJ6 765 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 CPLX3Q8WVH0 158 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 CLIP3Q96DZ5 547 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 DPYSL5Q9BPU6 564 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 TTPALQ9BTX7 342 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 PLA2G12BQ9BX93 195 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 SLC6A20Q9NP91 592 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 TLR9Q9NR96 1032 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 LRP2BPQ9P2M1 347 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 EFR3BQ9Y2G0 817 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 PTPN22Q9Y2R2 807 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 GIT1Q9Y2X7 761 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 PCSK5Q92824 1860 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 SLC27A2O14975 620 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 FAHP16930 419 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 FBLP22087 321 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 PFKPQ01813 784 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 CCDC142Q17RM4 750 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 RNF151Q2KHN1 245 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 ULK2Q8IYT8 1036 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF839A8K0R7 811 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 ARHGAP6O43182 974 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 RRADP55042 308 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 CYP4F3Q08477 520 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 SPIRE1Q08AE8 756 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 CRHR2Q13324 411 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 TUSC3Q13454 348 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 CD276Q5ZPR3 534 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 PCSK4Q6UW60 755 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF627Q7L945 461 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 SGMS1Q86VZ5 419 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 NELFAQ9H3P2 528 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 ESYT3A0FGR9 886 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 FOXN1O15353 648 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 RHOBTB3O94955 611 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD116-28-201ENST00000516123 LCP1P13796 627 aa3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms