RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 GGPS1O95749 300 aa22.63■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 SP2Q02086 613 aa22.63■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.63■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 FERMT2Q96AC1 680 aa22.63■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 RAB34Q9BZG1 259 aa22.63■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.63■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.62■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 SORBS3O60504 671 aa22.62■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 PSMD10O75832 226 aa22.62■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 GH1P01241 217 aa22.62■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 SMPD1P17405 629 aa22.62■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 ME1P48163 572 aa22.62■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.62■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 GDF15Q99988 308 aa22.62■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.62■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.62■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 WDR81Q562E7 1941 aa22.62■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 TECP42680 631 aa22.61■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 KRT76Q01546 638 aa22.61■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 METTL7BQ6UX53 244 aa22.61■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.61■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 COPS5Q92905 334 aa22.61■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 CHMP2AO43633 222 aa22.6■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 RARBP10826 455 aa22.6■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 BMP8BP34820 402 aa22.6■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 SP4Q02446 784 aa22.6■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 LAMC2Q13753 1193 aa22.6■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.6■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.6■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.6■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 VAV3Q9UKW4 847 aa22.6■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 CUTAO60888 179 aa22.59■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 ARHGAP1Q07960 439 aa22.59■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 PPP2R5CQ13362 524 aa22.59■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 LRRC41Q15345 812 aa22.59■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.59■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 TLK2Q86UE8 772 aa22.59■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 SPATA33Q96N06 139 aa22.59■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.59■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 SAMM50Q9Y512 469 aa22.59■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 ELP1O95163 1332 aa22.58■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 WDR64B1ANS9 1081 aa22.58■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 ADCY6O43306 1168 aa22.58■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 JAK3P52333 1124 aa22.58■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 PDIA5Q14554 519 aa22.58■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 IL17AQ16552 155 aa22.58■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.58■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 SPC25Q9HBM1 224 aa22.58■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.58■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.58■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 Q9Y3F1 56 aa22.58■■□□□ 1.21
SMIM20-201ENST00000506197 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.57■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 POTEMA6NI47 508 aa22.57■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.57■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 SFNP31947 248 aa22.57■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 RTP1P59025 263 aa22.57■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 ERMNQ8TAM6 284 aa22.57■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 AK8Q96MA6 479 aa22.57■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.57■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.57■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 STK24Q9Y6E0 443 aa22.57■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 LTBP2Q14767 1821 aa22.57■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 ACTR2P61160 394 aa22.56■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.56■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.56■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 RDM1Q8NG50 284 aa22.56■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 CLIC6Q96NY7 704 aa22.56■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 CSRNP2Q9H175 543 aa22.56■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 DISC1Q9NRI5 854 aa22.56■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 CCNE2O96020 404 aa22.55■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 PTGS1P23219 599 aa22.55■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 CPT1AP50416 773 aa22.55■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 GRIN1Q05586 938 aa22.55■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.55■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.55■■□□□ 1.2
SMIM20-201ENST00000506197 RNF180Q86T96 592 aa22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms