RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 SCRN1Q12765 414 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP26C1Q6V0L0 522 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TAOK1Q7L7X3 1001 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC43Q8N309 656 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC150Q8NCX0 1101 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PXYLP1Q8TE99 480 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SGCDQ92629 289 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC45Q96CN5 670 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CNNM2Q9H8M5 875 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPRHQ9HD43 1115 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SSUH2Q9Y2M2 353 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 LAMB2P55268 1798 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 ASNSP08243 561 aa5.06□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 OSTM1Q86WC4 334 aa5.06□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 SNAP23O00161 211 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP8B1O43520 1251 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF254O75437 659 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 HMGCRP04035 888 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 HPDP32754 393 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 COPAP53621 1224 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PDE4DQ08499 809 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CUL4BQ13620 913 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ACAP1Q15027 740 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 MFN1Q8IWA4 741 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 NUP133Q8WUM0 1156 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 MS4A4AQ96JQ5 239 aa5.05□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 PCP11498 1178 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 TADA2BQ86TJ2 420 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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