RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	JAM3	Q9BX67	310 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF839	A8K0R7	811 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	SLC27A2	O14975	620 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	DLX3	O60479	287 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	FHL2	Q14192	279 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	SV2C	Q496J9	727 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	CD276	Q5ZPR3	534 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	EPN3	Q9H201	632 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	ACOT7	O00154	380 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	MATN2	O00339	956 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	RAD17	O75943	681 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	TGFB2	P61812	414 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	PFKP	Q01813	784 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	GRIN1	Q05586	938 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	DPT	Q07507	201 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	HS1BP3	Q53T59	392 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	FUK	Q8N0W3	1084 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	CHFR	Q96EP1	664 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	ADO	Q96SZ5	270 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952		A0A1W2PQU0	124 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	LTF	P02788	710 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	COMT	P21964	271 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	KCNJ6	P48051	423 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	TUSC3	Q13454	348 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	EXTL1	Q92935	676 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	POLD1	P28340	1107 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	NFYC	Q13952	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952		H0Y858	1186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	CUTA	O60888	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF202	O95125	648 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	INHBE	P58166	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	PTH1R	Q03431	593 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	NTRK3	Q16288	839 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	FBXO21	O94952	628 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	TGM1	P22735	817 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	GLRB	P48167	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	DGCR2	P98153	550 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	CFHR4	Q92496	578 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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