RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488814.5

FUBP1-210, Transcript of far upstream element binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene FUBP1, Length 612 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1-210ENST00000488814 ICAM1P05362 532 aa7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 PTPRAP18433 802 aa7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 VCAM1P19320 739 aa7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 EPHX2P34913 555 aa7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 ZNF76P36508 570 aa7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 TECP42680 631 aa7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 TXKP42681 527 aa7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 AFMP43652 599 aa7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 BACE1P56817 501 aa7.37□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 ILDR2Q71H61 639 aa7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 LUZP1Q86V48 1076 aa7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 PAGE5Q96GU1 130 aa7.37□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 C12orf42Q96LP6 360 aa7.37□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 CUEDC2Q9H467 287 aa7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 MAGEF1Q9HAY2 307 aa7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.37□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.37□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 CSADQ9Y600 493 aa7.37□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 ZHX2Q9Y6X8 837 aa7.37□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 ADCY5O95622 1261 aa7.36□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 SREBF1P36956 1147 aa7.36□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 KRT79Q5XKE5 535 aa7.36□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.36□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 LDHDQ86WU2 507 aa7.36□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.36□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 SAMD3Q8N6K7 520 aa7.36□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.36□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.36□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 MTMR9Q96QG7 549 aa7.36□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 MAN1B1Q9UKM7 699 aa7.36□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 SSC5DA1L4H1 1573 aa7.36□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 A0A087X0B3 334 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 PP2D1A8MPX8 630 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 TBX3O15119 743 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 FOXN1O15353 648 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 SLC26A4O43511 780 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 MYL1P05976 194 aa7.35□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 ALAS1P13196 640 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 CYP3A7P24462 503 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 HMGCS2P54868 508 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 RELBQ01201 579 aa7.35□□□□□ -1.23
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FUBP1-210ENST00000488814 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 CPXCR1Q8N123 301 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 MLKLQ8NB16 471 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 ERMNQ8TAM6 284 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 CDCA5Q96FF9 252 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 PDLIM2Q96JY6 352 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 MBOAT7Q96N66 472 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 GSDMAQ96QA5 445 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 LRRC27Q9C0I9 530 aa7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
FUBP1-210ENST00000488814 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa7.35□□□□□ -1.23
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