RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439083.5

TNS1-208, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-208ENST00000439083 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.54■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 V9GY48 417 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 TTC28Q96AY4 2481 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 GBF1Q92538 1859 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 PSMA5P28066 241 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 NAPAP54920 295 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 FGD1P98174 961 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 TCTN1Q2MV58 587 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 FAM26DQ5JW98 314 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 TAF2Q6P1X5 1199 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 TRIM50Q86XT4 487 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 FBXL16Q8N461 479 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 SEPT8Q92599 483 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 ASB2Q96Q27 587 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 PRDM6Q9NQX0 595 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 BARHL2Q9NY43 387 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 ERAP1Q9NZ08 941 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 MTCH2Q9Y6C9 303 aa16.53■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 VCANP13611 3396 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 GOLGA8AA7E2F4 631 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 GOLGA8BA8MQT2 603 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 ARHGEF15O94989 841 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 AMHP03971 560 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 SP4Q02446 784 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 LMBR1Q8WVP7 490 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 TCEANC2Q96MN5 208 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 MXRA8Q9BRK3 442 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 TELO2Q9Y4R8 837 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 INSL6Q9Y581 213 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-208ENST00000439083 STXBP3O00186 592 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 RFXAPO00287 272 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 HSPA4P34932 840 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 ADCY7P51828 1080 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 ERVK-21P61565 698 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 ARHGAP4P98171 946 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 AP3B2Q13367 1082 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 MCTP2Q6DN12 878 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 APBB2Q92870 758 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 CERS4Q9HA82 394 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 KCNH7Q9NS40 1196 aa16.51■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 NFASCO94856 1347 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 LCHNA4D1U4 455 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 SMCO2A6NFE2 343 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 EPOPA6NHQ4 379 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 RRN3P2A6NIE6 340 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 MEIS1O00470 390 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 CDC27P30260 824 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 SREBF1P36956 1147 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 PPFIA1Q13136 1202 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 AAK1Q2M2I8 961 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 CEP55Q53EZ4 464 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 RSPH3Q86UC2 560 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 GLG1Q92896 1179 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 ANO3Q9BYT9 981 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 SLC9A2Q9UBY0 812 aa16.5■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 LINC01553A4QN01 128 aa16.49■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 LPXNO60711 386 aa16.49■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 GRB10Q13322 594 aa16.49■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa16.49■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 NIPA1Q7RTP0 329 aa16.49■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 TOP1MTQ969P6 601 aa16.49■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 SDF4Q9BRK5 362 aa16.49■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 AGXT2Q9BYV1 514 aa16.49■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 COG5Q9UP83 839 aa16.49■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 ESYT2A0FGR8 921 aa16.48■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 CTSHP09668 335 aa16.48■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 ADD1P35611 737 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 GRIK4Q16099 956 aa16.48■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa16.48■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 MYOCDQ8IZQ8 938 aa16.48■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16.48■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 AZI2Q9H6S1 392 aa16.48■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 PKD2L1Q9P0L9 805 aa16.48■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 TUBE1Q9UJT0 475 aa16.48■□□□□ 0.23
TNS1-208ENST00000439083 SNX14Q9Y5W7 946 aa16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms