RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366170.6

VSTM1-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSTM1, Length 654 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1-202ENST00000366170 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 JAK3P52333 1124 aa14.58□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.58□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.58□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.58□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 COPS5Q92905 334 aa14.58□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 WDR64B1ANS9 1081 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 SLC26A4O43511 780 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 HMGCRP04035 888 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 PSAPP07602 524 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 SMPD1P17405 629 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 LIG1P18858 919 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 GRK4P32298 578 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 NDUFA8P51970 172 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 LBX1P52954 281 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 ACTR2P61160 394 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 METTL7BQ6UX53 244 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 PDILTQ8N807 584 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 RDM1Q8NG50 284 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 SPATA33Q96N06 139 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 PLIN2Q99541 437 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.57□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 TRAK2O60296 914 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 ZNF202O95125 648 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 CCNE2O96020 404 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 AKR1A1P14550 325 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 RPA1P27694 616 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 TRIM32Q13049 653 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 TPH2Q8IWU9 490 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 IQUBQ8NA54 791 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 NEK9Q8TD19 979 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 DYDC2Q96IM9 177 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 RGL1Q9NZL6 768 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 HPSEQ9Y251 543 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.56□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 NR1I2O75469 434 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 SLITRK3O94933 977 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 ATG7O95352 703 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 CYBAP13498 195 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 STAT6P42226 847 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 ARHGAP1Q07960 439 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 TRPV1Q8NER1 839 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 ENGASEQ8NFI3 743 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 GPT2Q8TD30 523 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 DHX58Q96C10 678 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.55□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 BACH1O14867 736 aa14.54□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 SEPT4O43236 478 aa14.54□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 KINO60870 393 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 MED24O75448 989 aa14.54□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.54□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 MUTP22033 750 aa14.54□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 PSMC5P62195 406 aa14.54□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 CYP4A11Q02928 519 aa14.54□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 GRB10Q13322 594 aa14.54□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.54□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
VSTM1-202ENST00000366170 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms