RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363507.1

SNORD56.3-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.3-201ENST00000363507 ECHS1P30084 290 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 EPS15P42566 896 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 TECP42680 631 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 SCTRP47872 440 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 PSEN1P49768 467 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 DNA2P51530 1060 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 GSTO1P78417 241 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 ATP2B2Q01814 1243 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 KLHL30Q0D2K2 578 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 COASYQ13057 564 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 XRCC4Q13426 336 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 RAPGEF1Q13905 1077 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 PDIA5Q14554 519 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 ITIH4Q14624 930 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 CLUL1Q15846 466 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 PPP2R5EQ16537 467 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 COL24A1Q17RW2 1714 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 SLC35G1Q2M3R5 365 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 NBPF9Q3BBW0 867 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 ODF2Q5BJF6 829 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAM26FQ5R3K3 315 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 C12orf60Q5U649 245 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 KRT79Q5XKE5 535 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 PPP1R18Q6NYC8 613 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 CYB5D1Q6P9G0 228 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 BRINP3Q76B58 766 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMC4Q7Z404 712 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMC3Q7Z5M5 1100 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 CROCCP2Q86T23 111 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 SBF2Q86WG5 1849 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 TRIM59Q8IWR1 403 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCDC65Q8IXS2 484 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 SYCE1Q8N0S2 351 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 RASGEF1CQ8N431 466 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 LRRC57Q8N9N7 239 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCDC197Q8NCU1 140 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCDC26Q8TAB7 109 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 SNX29Q8TEQ0 813 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 LMBR1Q8WVP7 490 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 SEC14L1Q92503 715 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 RAPGEF5Q92565 580 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 TBC1D5Q92609 795 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 HPS3Q969F9 1004 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 TLCD1Q96CP7 247 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 HVCN1Q96D96 273 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 PNMA5Q96PV4 448 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 MTMR9Q96QG7 549 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMEM47Q9BQJ4 181 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAM129AQ9BZQ8 928 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 RAB17Q9H0T7 212 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 GANQ9H2C0 597 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 KDM4CQ9H3R0 1056 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 CENPHQ9H3R5 247 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 MKNK2Q9HBH9 465 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 VEZTQ9HBM0 779 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZNF287Q9HBT7 754 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 NLRC4Q9NPP4 1024 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 IL17RBQ9NRM6 502 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 HAUS2Q9NVX0 235 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 MCM9Q9NXL9 1143 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 FBXL5Q9UKA1 691 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 INTUQ9ULD6 942 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 ODF2LQ9ULJ1 636 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 KAT6BQ8WYB5 2073 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZNF831Q5JPB2 1677 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 SNED1Q8TER0 1413 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 NCANO14594 1321 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 A0A1B0GUA9 196 aa3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms