RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354662.5

LMO3-204, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,574 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-204ENST00000354662 LIN52Q52LA3 116 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 C11orf74Q86VG3 221 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 CREG2Q8IUH2 290 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 ETNK2Q9NVF9 386 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 STK32BQ9NY57 414 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 RREB1Q92766 1687 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 NUP188Q5SRE5 1749 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 PTPN2P17706 415 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 ADARP55265 1226 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 ITGA9Q13797 1035 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 DDB1Q16531 1140 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 UNC13DQ70J99 1090 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 CPLX4Q7Z7G2 160 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 TSPYL6Q8N831 410 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 UCMAQ8WVF2 138 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 FAM114A2Q9NRY5 505 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 MKS1Q9NXB0 559 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 PRELID1Q9Y255 219 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 POTEJP0CG39 1038 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 CMA1P23946 247 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 VAV2P52735 878 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 RBL2Q08999 1139 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 MYO1HQ8N1T3 1032 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 ESX1Q8N693 406 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 LINC00301Q8NCQ3 95 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 HGH1Q9BTY7 390 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 GBA3Q9H227 469 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 TPK1Q9H3S4 243 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 ECT2Q9H8V3 914 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 JADE2Q9NQC1 790 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 A8MUI8 341 aa8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 CHGBP05060 677 aa8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 ERVK-24P63145 666 aa8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 CCDC14Q49A88 953 aa8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 NT5DC1Q5TFE4 455 aa8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 IL23RQ5VWK5 629 aa8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 Q6ZNX1 250 aa8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 LSMEM2Q8N112 164 aa8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 HAUS1Q96CS2 278 aa8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 TMEM237Q96Q45 408 aa8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 CCT7Q99832 543 aa8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 CENPKQ9BS16 269 aa8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 HPSEQ9Y251 543 aa8.96□□□□□ -0.97
LMO3-204ENST00000354662 O00370 1275 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 RPS6KB1P23443 525 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 NFKBIAP25963 317 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 WASHC2DQ5SRD0 308 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 SYCP2LQ5T4T6 812 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 CCNJLQ8IV13 435 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 FNDC8Q8TC99 324 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 SIKE1Q9BRV8 207 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 NRAPQ86VF7 1730 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 MATN2O00339 956 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 SEMA3EO15041 775 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 STAM2O75886 525 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 POTEIP0CG38 1075 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 TXKP42681 527 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 RAD23BP54727 409 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 LONP2Q86WA8 852 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 NAT14Q8WUY8 206 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 DPH5Q9H2P9 285 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa8.95□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
LMO3-204ENST00000354662 CETN3O15182 167 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms