RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PDHBP11177 359 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 RPS6KB1P23443 525 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 AFMP43652 599 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF20Q3BBV1 942 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D10CQ8IV04 446 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 PGBD4Q96DM1 585 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ARID3AQ99856 593 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ORC4O43929 436 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHA8P1O95397 391 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 BMP15O95972 392 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TECP42680 631 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 RDH13Q8NBN7 331 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 SPATA32Q96LK8 384 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 MEIS1O00470 390 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 PRRG1O14668 218 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 CEP55Q53EZ4 464 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 TRPV6Q9H1D0 765 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 DACT1Q9NYF0 836 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 TCP11Q8WWU5 503 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 COL4A1P02462 1669 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEB2O15479 319 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 DYMQ7RTS9 669 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 RNF34Q969K3 372 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 MAPK6Q16659 721 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 RNF149Q8NC42 400 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 IWS1Q96ST2 819 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 EXOC1Q9NV70 894 aa4.93□□□□□ -1.62
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