RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 HSPH1Q92598 858 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 CDHR1Q96JP9 859 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.2■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 ZWILCHQ9H900 591 aa24.2■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 NLRP1Q9C000 1473 aa24.2■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 MSH2P43246 934 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 IL9RQ01113 521 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 GDAP1Q8TB36 358 aa24.2■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 DSTYKQ6XUX3 929 aa24.2■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 SMIM24O75264 130 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 ATP8B3O60423 1300 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 NPR1P16066 1061 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 SLCO1A2P46721 670 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 HIP1RO75146 1068 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 RWDD2AQ9UIY3 292 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.18■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.18■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 STX1BP61266 288 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 RNF139Q8WU17 664 aa24.18■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 TTC4O95801 387 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 SLFN14P0C7P3 912 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 TCP11X2Q5H9J9 407 aa24.18■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 MXI1P50539 228 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 PEX3P56589 373 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 TOM1L1O75674 476 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 CYP2D6P10635 497 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 EPHB1P54762 984 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 CDC26Q8NHZ8 85 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 PIGOQ8TEQ8 1089 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 GH2P01242 217 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 SLFNL1Q499Z3 407 aa24.17■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 POLIQ9UNA4 740 aa24.17■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 AP1M1Q9BXS5 423 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 BANK1Q8NDB2 785 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 GANCQ8TET4 914 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 FAM160B2Q86V87 743 aa24.16■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 OR6B3Q8NGW1 331 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa24.16■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
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PTPRM-201ENST00000332175 LMCD1Q9NZU5 365 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 CEP170Q5SW79 1584 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 WDR91A4D1P6 747 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 GNGT2O14610 69 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRM-201ENST00000332175 SOX5P35711 763 aa24.15■■□□□ 1.46
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