RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 NR1I3Q14994 352 aa21.36■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 TTI2Q6NXR4 508 aa21.36■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 CCDC65Q8IXS2 484 aa21.36■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.36■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 EYA4O95677 639 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 SPAG1Q07617 926 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 ARID5BQ14865 1188 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 TRIM47Q96LD4 638 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 TRAF5O00463 557 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 PEX10O60683 326 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 MOGSQ13724 837 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 TCP11X2Q5H9J9 407 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD40Q6AI12 368 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 KCNJ18B7U540 433 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 HERVK_113P62684 666 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 GIT2Q14161 759 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 KCNJ12Q14500 433 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 CENPPQ6IPU0 288 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 IRF2BP1Q8IU81 584 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 THAP9Q9H5L6 903 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 FBXO40Q9UH90 709 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-201ENST00000331803 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.33■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 KRT31Q15323 416 aa21.33■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 PTPN21Q16825 1174 aa21.33■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.33■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 FAM26FQ5R3K3 315 aa21.33■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD35Q8N283 1001 aa21.33■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.33■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 NEK9Q8TD19 979 aa21.33■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 NACC1Q96RE7 527 aa21.33■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 SEMA6BQ9H3T3 888 aa21.33■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.33■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 MAFGO15525 162 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 ATP9AO75110 1047 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 GPRASP2Q96D09 838 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 LXNQ9BS40 222 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 UNCXA6NJT0 531 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 GJA5P36382 358 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 LRRC41Q15345 812 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 NLRX1Q86UT6 975 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 GLIS3Q8NEA6 775 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 REEP2Q9BRK0 252 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 PAGR1Q9BTK6 254 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB39O15060 712 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 TEX33O43247 280 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 SNAPC2Q13487 334 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 RINT1Q6NUQ1 792 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 BANK1Q8NDB2 785 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 ZHX3Q9H4I2 956 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 RRAGCQ9HB90 399 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 SAMM50Q9Y512 469 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 PFASO15067 1338 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 OSBPP22059 807 aa21.3■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.3■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.3■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.3■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 DNERQ8NFT8 737 aa21.3■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 N4BP3O15049 544 aa21.29■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 CNMDO75829 334 aa21.29■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 STAM2O75886 525 aa21.29■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
UPP1-201ENST00000331803 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.5 ms