RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328020.10

CMTM1-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM1, Length 981 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-201ENST00000328020 PPP2R5CQ13362 524 aa15.87■□□□□ 0.13
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CMTM1-201ENST00000328020 KCNA10Q16322 511 aa15.87■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 HSDL1Q3SXM5 330 aa15.87■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.87■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 FAM160B1Q5W0V3 765 aa15.87■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 MIER3Q7Z3K6 550 aa15.87■□□□□ 0.13
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CMTM1-201ENST00000328020 GLT1D1Q96MS3 346 aa15.87■□□□□ 0.13
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CMTM1-201ENST00000328020 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
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CMTM1-201ENST00000328020 NCAPH2Q6IBW4 605 aa15.85■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 FAM173BQ6P4H8 233 aa15.85■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 NECAB2Q7Z6G3 386 aa15.85■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 C4orf32Q8N8J7 132 aa15.85■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 ATP6V0A1Q93050 837 aa15.85■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 UNC45AQ9H3U1 944 aa15.85■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 VAV3Q9UKW4 847 aa15.85■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 PHF24Q9UPV7 400 aa15.85■□□□□ 0.13
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CMTM1-201ENST00000328020 SLC39A14Q15043 492 aa15.84■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
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CMTM1-201ENST00000328020 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa15.84■□□□□ 0.13
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CMTM1-201ENST00000328020 GJA10Q969M2 543 aa15.84■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 USP28Q96RU2 1077 aa15.84■□□□□ 0.13
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CMTM1-201ENST00000328020 ZNF302Q9NR11 478 aa15.84■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 ERAP1Q9NZ08 941 aa15.84■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 LRWD1Q9UFC0 647 aa15.84■□□□□ 0.13
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CMTM1-201ENST00000328020 EMSYQ7Z589 1322 aa15.84■□□□□ 0.13
CMTM1-201ENST00000328020 PTGS1P23219 599 aa15.83■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 STAT5BP51692 787 aa15.83■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 EPHA7Q15375 998 aa15.83■□□□□ 0.12
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CMTM1-201ENST00000328020 AK8Q96MA6 479 aa15.83■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 C11orf49Q9H6J7 331 aa15.83■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 STARD7Q9NQZ5 370 aa15.83■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 A0A1W2PQY0 241 aa15.82■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 POTEFA5A3E0 1075 aa15.82■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 VWA3AA6NCI4 1184 aa15.82■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 H3BRB1 525 aa15.82■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 SPTLC2O15270 562 aa15.82■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 PPP6R2O75170 966 aa15.82■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 LGR5O75473 907 aa15.82■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 F2P00734 622 aa15.82■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 P4HBP07237 508 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CMTM1-201ENST00000328020 EN2P19622 333 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
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