RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.55e-7■■■■□ 25.4
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLCB4Q15147 1175 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 FUKQ8N0W3 1084 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 GIMAP7Q8NHV1 300 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SCFD2Q8WU76 684 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 PIGSQ96S52 555 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 BTG4Q9NY30 223 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 STK17AQ9UEE5 414 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABCA3Q99758 1704 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 LAMB1P07942 1786 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 DAPK3O43293 454 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF4AO95239 1232 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZCWPW2Q504Y3 356 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYB5D1Q6P9G0 228 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SUFUQ9UMX1 484 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 EDIL3O43854 480 aa24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACTN1P12814 892 aa24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 AMACRQ9UHK6 382 aa24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 MCM8Q9UJA3 840 aa24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 GNA11P29992 359 aa24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTK2Q05397 1052 aa24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SOGA3Q5TF21 947 aa24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 PARP9Q8IXQ6 854 aa24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 OPLAHO14841 1288 aa24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP2R2AP63151 447 aa24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 COASYQ13057 564 aa24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASIC2Q16515 512 aa24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 MDM1Q8TC05 714 aa24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC45Q96CN5 670 aa24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SCLT1Q96NL6 688 aa24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 PSEN1P49768 467 aa24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CUL1Q13616 776 aa24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 NEDD9Q14511 834 aa24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 METTL13Q8N6R0 699 aa24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC19Q96DA6 116 aa24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 DRP2Q13474 957 aa24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SCTRP47872 440 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP11P51784 963 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 E2F5Q15329 346 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNCBQ16143 134 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM59Q8IWR1 403 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 DONSONQ9NYP3 566 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 AIPL1Q9NZN9 384 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 PROM2Q8N271 834 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM170AA1A519 330 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT79Q5XKE5 535 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 COA7Q96BR5 231 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 DPH5Q9H2P9 285 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 PANK4Q9NVE7 773 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 PHLPP1O60346 1717 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SCN7AQ01118 1682 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRIT1O00522 736 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTI1O43156 1089 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 RASA1P20936 1047 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SCP2P22307 547 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ELF1P32519 619 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 BIRC3Q13489 604 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ITPK1Q13572 414 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM26FQ5R3K3 315 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 WLSQ5T9L3 541 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC57Q8N9N7 239 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM31Q9BZY9 425 aa24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms