RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 DEFB103AP81534 67 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 MBTPS1Q14703 1052 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 GLG1Q92896 1179 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 RAD9AQ99638 391 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 BARHL2Q9NY43 387 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 SMCO2A6NFE2 343 aa23.09■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 AP3B2Q13367 1082 aa23.09■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 TAF2Q6P1X5 1199 aa23.09■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 RSPH3Q86UC2 560 aa23.09■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 IL27Q8NEV9 243 aa23.09■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.09■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.09■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.09■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 SDF4Q9BRK5 362 aa23.09■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 TET1Q8NFU7 2136 aa23.09■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 GBF1Q92538 1859 aa23.09■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 STXBP3O00186 592 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 CTSHP09668 335 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 PSMA5P28066 241 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 FUT2Q10981 343 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 PPFIA1Q13136 1202 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 KCNB2Q92953 911 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 ANO3Q9BYT9 981 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 AZI2Q9H6S1 392 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 VCANP13611 3396 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC9B-201ENST00000311308 HSPA4P34932 840 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF76P36508 570 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 Q6ZUG5 572 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 INSL6Q9Y581 213 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 MARK3P27448 753 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 CDC27P30260 824 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 ADAM17P78536 824 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 TCTN1Q2MV58 587 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 CEP55Q53EZ4 464 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 MCTP2Q6DN12 878 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 APBB2Q92870 758 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 BRF1Q92994 677 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 NFASCO94856 1347 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 RFXAPO00287 272 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 APOBRQ0VD83 1088 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 GRIK4Q16099 956 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 RPAINQ86UA6 219 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 PGBD1Q96JS3 809 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 LCHNA4D1U4 455 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 ARHGEF15O94989 841 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 NEFLP07196 543 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 SCG2P13521 617 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 SREBF1P36956 1147 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 AAK1Q2M2I8 961 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 FAM26DQ5JW98 314 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 FBXL16Q8N461 479 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 ASB2Q96Q27 587 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 EPOPA6NHQ4 379 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 CPA1P15085 419 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 C6orf50Q9HD87 102 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 TRPC6Q9Y210 931 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 ESYT2A0FGR8 921 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 RPS6KB1P23443 525 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 GNA11P29992 359 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 ERVK-21P61565 698 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 GRB10Q13322 594 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC9B-201ENST00000311308 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms