RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.59■■□□□ 1.05
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SPNS1-201ENST00000311008 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-201ENST00000311008 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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SPNS1-201ENST00000311008 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.59■■□□□ 1.05
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SPNS1-201ENST00000311008 FAM196BA6NMK8 535 aa21.58■■□□□ 1.05
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SPNS1-201ENST00000311008 HSP90B2PQ58FF3 399 aa21.58■■□□□ 1.05
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SPNS1-201ENST00000311008 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
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SPNS1-201ENST00000311008 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.56■■□□□ 1.04
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SPNS1-201ENST00000311008 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.53■■□□□ 1.04
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SPNS1-201ENST00000311008 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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SPNS1-201ENST00000311008 RPL13P26373 211 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
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SPNS1-201ENST00000311008 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.042e-8■■■□□ 16.4
SPNS1-201ENST00000311008 SLC18A3Q16572 532 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC181Q5TID7 509 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
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