RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 STARD7Q9NQZ5 370 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 KAT6AQ92794 2004 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 ELP1O95163 1332 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 CHMP2AO43633 222 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 PSMD10O75832 226 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 CCNE2O96020 404 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 CHMP4BP1P59074 171 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 KRT76Q01546 638 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 CABYRO75952 493 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 SAMM50Q9Y512 469 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 LGALS2P05162 132 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 TXKP42681 527 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 PSMC6P62333 389 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 ALPK3Q96L96 1907 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM50Q86XT4 487 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 MTMR9Q96QG7 549 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 F13A1P00488 732 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 OR52Z1P0C646 297 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 PTGDRQ13258 359 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 KAT2BQ92831 832 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 WDR64B1ANS9 1081 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 GLG1Q92896 1179 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 AZI2Q9H6S1 392 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 DISC1Q9NRI5 854 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 VAV3Q9UKW4 847 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 H3BRB1 525 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 BACH1O14867 736 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 ATG7O95352 703 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 F2P00734 622 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 SFNP31947 248 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 ABHD15Q6UXT9 468 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 KATNAL1Q9BW62 490 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
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HOXD4-201ENST00000306324 PSEN2P49810 448 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 JAK3P52333 1124 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 PPP2R5CQ13362 524 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 ITGA7Q13683 1181 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 MFSD10Q14728 455 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 NCAPH2Q6IBW4 605 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 EMSYQ7Z589 1322 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 BRD1O95696 1058 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 NBPF20Q3BBV1 942 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 SWSAP1Q6NVH7 229 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 PCYT2Q99447 389 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 LAD1O00515 517 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 LGR5O75473 907 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 MARK3P27448 753 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 TECP42680 631 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 STAT5BP51692 787 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
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HOXD4-201ENST00000306324 FAM47CQ5HY64 1035 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 FAM160B1Q5W0V3 765 aa25.15■■□□□ 1.62
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF302Q9NR11 478 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 ERAP1Q9NZ08 941 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 CLIC4Q9Y696 253 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 GRIN2DO15399 1336 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 TCHHQ07283 1943 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 ARVCFO00192 962 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 EML1O00423 815 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 SPIRE1Q08AE8 756 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD4-201ENST00000306324 RDM1Q8NG50 284 aa25.15■■□□□ 1.62
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